Page 52 - 《水产学报》2026年第2期
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2 期                                     水    产    学    报                                 50 卷




                    跨组织/性别系统评估曼氏无针乌贼内参基因的稳定性



                             李    双,  谷    敏,  叶孝文,  叶    彬,  刘思语,
                                           余    佳,  周    旭,  迟长凤             *

                                  (浙江海洋大学海洋科学与技术学院,海洋生物种质资源发掘利用
                                         国家地方联合工程研究中心,浙江 舟山 316022)

                   摘要: 【目的】系统评估曼氏无针乌贼雌雄个体多种组织中                            5  个常用内参基因       (18S、ef-1α、
                   ef-1γ、gapdh  和  β-actin) 的表达稳定性,筛选适用于实时荧光定量                  PCR (qPCR) 分析的最佳
                   内参基因及其数量。 【方法】采集                10  尾健康曼氏无针乌贼         (雌雄各    5  尾) 的  15~16  种组织,
                   提取总    RNA  并反转录为       cDNA。通过     qPCR  检测基因表达,结合            geNorm、NormFinder、
                   BestKeeper 和  ΔC 等 t  4  种算法及  RefFinder 综合评价基因稳定性,利用            geNorm  配对变异分
                   析(V  n/n+1  < 0.15)确定最佳内参基因数量。选取             4  个转录组来源的靶基因           (creld2、cd109、
                                                           t
                   acy1、miox) 进行验证。 【结果】5          个基因    C 值为   15.47~20.83,β-actin  和  gapdh  在组织及
                   性别间波动最大,不宜作为通用内参;18S                   表达量最高       (C 均值为    15.47~16.29),变异最小,
                                                                        t
                   但存在性别偏倚表达;ef-1α           与  ef-1γ 在多数组织和      2  个性别中表现出较高的稳定性,其中
                   ef-1α  表达最稳定,无任何性别偏倚。虽然各基因在不同组织和性别间的稳定性模式及具
                   体排名存在差异,但多算法综合结果表明,ef-1α                       和  ef-1γ 整体稳定性最高,其次为            18S,
                   而  β-actin  和  gapdh  稳定性最低,在雌雄中的最终排名为                 ef-1γ > ef-1α > 18S > gapdh > β-
                   actin (雄);ef-1α > ef-1γ > 18S > gapdh > β-actin (雌)。geNorm  分析显示,多数组织使用         2  个
                   内参基因 (主要为       ef-1α  和  ef-1γ) 即可满足归一化要求 (V  < 0.15)。验证实验表明,使用稳
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                   定内参组合      (ef-1α  和  ef-1γ) 能准确反映组织间表达差异,而使用不稳定内参基因组合                           (β-
                   actin  和  gapdh) 则导致多数靶基因失去统计显著性。 【结论】ef-1α                  和  ef-1γ 是曼氏无针乌贼
                   qPCR  分析中最适宜的内参基因组合,18S                 可作为辅助基因用于性别内比较,避免单独使
                   用  β-actin  或  gapdh。本研究首次建立了曼氏无针乌贼内参基因选择的系统化框架,为后续
                   曼氏无针乌贼及其他头足类基因表达研究提供了可靠参考。
                   关键词: 曼氏无针乌贼;内参基因;实时荧光定量                       PCR;表达稳定性;RefFinder

                   中图分类号: Q 78; S 91                                    文献标志码: A

























              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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