Page 52 - 《水产学报》2026年第2期
P. 52
2 期 水 产 学 报 50 卷
跨组织/性别系统评估曼氏无针乌贼内参基因的稳定性
李 双, 谷 敏, 叶孝文, 叶 彬, 刘思语,
余 佳, 周 旭, 迟长凤 *
(浙江海洋大学海洋科学与技术学院,海洋生物种质资源发掘利用
国家地方联合工程研究中心,浙江 舟山 316022)
摘要: 【目的】系统评估曼氏无针乌贼雌雄个体多种组织中 5 个常用内参基因 (18S、ef-1α、
ef-1γ、gapdh 和 β-actin) 的表达稳定性,筛选适用于实时荧光定量 PCR (qPCR) 分析的最佳
内参基因及其数量。 【方法】采集 10 尾健康曼氏无针乌贼 (雌雄各 5 尾) 的 15~16 种组织,
提取总 RNA 并反转录为 cDNA。通过 qPCR 检测基因表达,结合 geNorm、NormFinder、
BestKeeper 和 ΔC 等 t 4 种算法及 RefFinder 综合评价基因稳定性,利用 geNorm 配对变异分
析(V n/n+1 < 0.15)确定最佳内参基因数量。选取 4 个转录组来源的靶基因 (creld2、cd109、
t
acy1、miox) 进行验证。 【结果】5 个基因 C 值为 15.47~20.83,β-actin 和 gapdh 在组织及
性别间波动最大,不宜作为通用内参;18S 表达量最高 (C 均值为 15.47~16.29),变异最小,
t
但存在性别偏倚表达;ef-1α 与 ef-1γ 在多数组织和 2 个性别中表现出较高的稳定性,其中
ef-1α 表达最稳定,无任何性别偏倚。虽然各基因在不同组织和性别间的稳定性模式及具
体排名存在差异,但多算法综合结果表明,ef-1α 和 ef-1γ 整体稳定性最高,其次为 18S,
而 β-actin 和 gapdh 稳定性最低,在雌雄中的最终排名为 ef-1γ > ef-1α > 18S > gapdh > β-
actin (雄);ef-1α > ef-1γ > 18S > gapdh > β-actin (雌)。geNorm 分析显示,多数组织使用 2 个
内参基因 (主要为 ef-1α 和 ef-1γ) 即可满足归一化要求 (V < 0.15)。验证实验表明,使用稳
2/3
定内参组合 (ef-1α 和 ef-1γ) 能准确反映组织间表达差异,而使用不稳定内参基因组合 (β-
actin 和 gapdh) 则导致多数靶基因失去统计显著性。 【结论】ef-1α 和 ef-1γ 是曼氏无针乌贼
qPCR 分析中最适宜的内参基因组合,18S 可作为辅助基因用于性别内比较,避免单独使
用 β-actin 或 gapdh。本研究首次建立了曼氏无针乌贼内参基因选择的系统化框架,为后续
曼氏无针乌贼及其他头足类基因表达研究提供了可靠参考。
关键词: 曼氏无针乌贼;内参基因;实时荧光定量 PCR;表达稳定性;RefFinder
中图分类号: Q 78; S 91 文献标志码: A
https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
24

