Page 53 - 《水产学报》2025年第11期

胡利，等 水产学报, 2025, 49(11): 119105

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图 1 长牡蛎 Cgchitinase 基因家族染色体分布

Fig. 1 Chromosomal distribution of Cgchitinase gene family in C. gigas

2.2 Cgchitinase 家族基因结构域及 motif 组成 基序，编码内切酶基因具有相似基序，表明其
可能具有相似功能 (图 2)。
通过对 Cgchitinase 家族基因进行结构域分
析发现，所有家族基因均具有典型的几丁质分 2.3 Cgchitinase 家族基因的序列相似度及系统
解结构域即 Glyco-18 结构域，部分基因还具有 进化关系
几丁质结合结构域即 ChtBD2 结构域。Cgchit- Uncharacterized LOC105332578 与其他基因
inase 家族基因中 chit1 具有 1 个 Glyco-18 结构 序 列 差 异 较 大 ， 因 此 本 序 列 分 析 中 未 采 用
域及 3 个 ChtBD2 结构域。chi3l1-2 及 chit1l 均 Uncharacterized LOC105332578 进行序列比对。
具有 1 个 Glyco-18 结构域及 1 个 ChtBD2 结构 多序列比对结果显示，Cgchitinase 家族基因整
域。amcase-1 具有 1 个 Glyco-18 结构域及 2 个 体序列相似性为 25.49%。Glyco-18 结构域 (红
ChtBD2 结 构 域 。 amcase-2 除 具 有 1 个 Glyco- 色框) 相似性为 44.52%，除 Glyco-18 结构域外
18 结构域及 1 个 ChtBD2 结构域外，还具有 1 序列相似度较低 (图 3)。
个独特的可与 Ca 结合的低密度脂蛋白受体结 为了解析 Cgchitinase 家族基因的系统进化
2+
构域——LDLa 结构域。pchi 及 pchi1 均只具有 关系，将获得的目的基因与来自软体动物虾夷
1 个 Glyco-18 结构域。chi3l1-1 具有 1 个 Glyco- 扇贝 (Patinopecten yessoensis)、霸王莲花青螺
18 结 构 域 及 一 段 跨 膜 区 域 。 Uncharacterized (Lottia gigantea)、红鲍 (Haliotis rufescens)、光
LOC105332578 具有 5 个重复 Glyco-18 结构域 滑 双 脐 螺 (Biomphalaria glabrata)、 真 蛸
及 2 个 ChtBD2 结 构 域 。 ctbs 具 有 1 个 Glyco- (Octopus vulgaris)、中华蛸 (O. sinensis) 及加州
18 结构域及一段跨膜结构域 (图 2)。 海兔 (Aplysia californica) 的共 50 个几丁质酶家
本研究将鉴定到的 12 个 motif，分别命名 族基因使用本地化 Muscle 程序及 IQ-Tree 2 进
为 motif 1~12。 通 过 对 Cgchitinase 家 族 进 行 行氨基酸多序列比对及系统进化分析。结果显
motif 分析发现，motif 4 及 motif 12 在所有家族 示，几丁质酶家族基因中的外切酶基因 ctbs 相
基因中均存在。几丁质外切酶基因 ctbs 仅有少 互聚为一支，与其他基因进化关系较远。其中
数基序，与内切酶基序相差较大，表明在功能 长牡蛎的 ctbs-2 与虾夷扇贝中 di-N-acetylchito-
上有所差异。相比之下，编码内切酶的基因均 biase-like 聚为一支后与红鲍中 Di-N-acetylchito-
含有更多基序，其中 amcase-1、uncharacterized biase-like 聚为一支，最终与长牡蛎的 ctbs-1 聚
LOC105332578、 chit1l 及 chit1 含 有 motif 1~12 为一支。而其余均为内切酶，其中长牡蛎中
全部基序。其余编码内切酶的基因均存在基序 chit1 与 chit1l 聚为一支之后与 chi3l1-2 聚为一
残缺现象，但大部分按照 motif 2、7、1、10、3、 支，最后与 amcase-2 及虾夷扇贝的几丁质酶聚
4、6、9、5 顺序排列。pchi 及 pchi1 具有相同 为一大支。长牡蛎中 pchi 与 pchi1 聚为一支。

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