Page 45 - 《水产学报》2025年第6期
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2025, 49(6): 069604                                    JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA

              DOI: 10.11964/jfc.20230714075





              黄姑鱼低温耐受性的全基因组关联分析







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              金    鲟 ，  刘炳舰 ，  竺奇慧 ，  张万昌 ，  李完波 ，  王志勇 ，                        第一作者：金鲟，从事群体遗传学方
                                                                                 面研究，E-mail：J782289657@163.com
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              高天翔 ，  徐冬冬       2*
              1. 浙江海洋大学海洋科学与技术学院，海洋生物种质资源发掘利用国家地方联合
              工程实验室，浙江 舟山 316021；2. 浙江省海洋水产研究所，浙江省海水增养殖
              重点实验室，浙江 舟山 316021；3. 南昌大学生命科学学院，江西 南昌 330038；
              4. 集美大学水产学院，福建 厦门 361000

              摘要：

                【目的】研究黄姑鱼应对低温胁迫的分子机制，为黄姑鱼养殖过程中                                   通信作者：徐冬冬，从事鱼类遗传学
              应对极端低温带来的挑战提供理论参考。                                                 和  遗  传  育  种  研  究  ，  E -mail ：
                                                                                 xudong0580@163.com
                【方法】本研究以        200  尾养殖黄姑鱼为实验材料，通过               5 °C  的低温胁
                                                                                 资助项目：浙江省“三农九方”科技协
              迫，记录每尾实验鱼低温胁迫下的存活时间及体重、体长、性别等表                                     作计划项目(2023SNJF078)；浙江省杰
                                                                                 出青年基金(LR21C190001)；国家自然
              型参数，然后进行全基因组重测序。获得                     3 005 715  个高质量单核苷酸         科学基金   (31972785)
              多态性    (SNPs) 位点，并用于基于混合线性模型                 (MLM) 的   EMMAX   软
                                                                                 收稿日期：2023-07-11
              件进行全基因组关联分析 (GWAS)。                                                修回日期：2023-11-02

                【结果】体重、体长及性别等各种表型参数均与耐低温时长不显著相                                   文章编号：
                                                                                 1000-0615(2025)06-069604-12
              关 (P=0.834~0.013)，在   24  条染色体上定位到         9  个与耐低温时长显著关           中图分类号：S 961.6
                                −6
                                          −8
              联的位点 (P=1.98×10 ~ 4.61×10 )，并注释到       CBL.3、STOML2.2、SLC37A3      文献标志码：A

              等共   13  个候选基因。基因功能注释发现，上述基因主要富集在免疫、                               作者声明本文无利益冲突

              防御修复、压力应激及线粒体能量代谢等过程，可能与黄姑鱼对低温                                     © 《水产学报》编辑部(CC BY-NC-ND 4.0)
                                                                                 Copyright © Editorial Office of Journal of
              响应相关。                                                              Fisheries of China (CC BY-NC-ND 4.0)
                【结论】研究结果可为后续黄姑鱼耐低温性状的遗传改良提供参考。
              关键词: 黄姑鱼；低温胁迫；单核苷酸多态性位点 (SNP)；全基因组关
              联分析


                   温度是鱼类生命活动的重要环境因子之一，贯穿鱼类各生长发育
              阶段   [1-2] 。当温度超过鱼类的自我调节阈值时，将导致其生理功能紊乱
              甚至死亡     [3-6] 。低温会抑制酶活性，影响鱼类摄食 、物质转化和免疫
                                                             [7]
                                             [8]
              防御等功能，进而抑制鱼类生长 。长时间的低温胁迫会导致鱼类能
              量代谢功能异常，机体损伤难以修复                   [9-12] 。近年来，随着全球极端天气
              事件频繁发生，水产养殖鱼类的耐低温研究也受到越来越多的关注。
              在基因组水平上，红鳍东方鲀                 (Takifugu rubripes) [13-14] 、罗非鱼  (Oreo-
              chromis  spp.) 、 牙 鲆  (Paralichthys  olivaceus) [16]  和 大 菱 鲆  (Scophthal-
                          [15]
              mus maximus) [17]  的研究中均开展了与低温耐受相关的分子标记筛选。
              如朱理光等      [13]  利用数量性状位点 (quantitative trait locus，QTL) 定位分


              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
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