Page 48 - 《水产学报》2025年第6期

金鲟，等 水产学报, 2025, 49(6): 069604

相关性不显著，表明生长性状与其耐低温无显 ~21.590 ×)；clean reads 的覆盖结果显示，平均
著相关性，因此在后续的 GWAS 分析中可以忽 覆盖率达到 98.261% (97.857%~98.515%)，平均
略生长性状的影响。 比对率为 98.30% (97.89%~98.75%)，表明测序
进一步对不同性别黄姑鱼的耐低温时长进 数据具有很高的覆盖性；在 GATK 的变异响应
行检测。首先进行分布情况的检测 (图 1)，发现 中，共获 3 005 715 个高质量 SNPs 位点，在
性别的分布情况较为一致。之后进行 Mann- 参考基因组上的分布较均匀，可用于后续的
Whitney U 检验，结果显示，Mann-Whitney U，
GWAS 分析。
Z=−0.210，P=0.834 (P > 0.05) (表 2)。由此可见，
群体结构分析结果显示，200 尾黄姑鱼的
耐低温时长与性别无显著相关性，因此在后续
分布连续，未出现明显的离群个体。在低 (D)、
的 GWAS 分析中可以忽略性别的影响。

中 (Z)、高 (G) 3 种类型分成的 3 个群体间，个
2.2 测序数据统计、群体结构及全基因组关联 体耐低温时长的分布较为均一 (图 2)，表明黄姑
分析 鱼在耐低温时长上不存在明显的群体分层现象。

经 Trimmomatic 过滤，共获得 1.26 × 10 条 通过耐低温时长的全基因组关联分析结果
10
clean reads；序列的平均深度为 15.60 × (10.123 × 的 Q-Q 图 ， 发 现 检 测 到 的 P-value 与 期 望 的
雌性 雄性

female male
120.0
96.0
74.0
72.0
68.0
66.0
63.0
存活时间/h survival time 58.0
54.0
52.0
48.0
28.0
26.0
24.0
14.0
6.0
0.5
0
50 40 30 20 10 0 10 20 30 40 50
频率
frequency
图 1 性别与存活时间相关的直方分布图
Fig. 1 Histogram of genetic sex and survival time

表 2 不同性别黄姑鱼的耐低温 Mann-Whitney U 检验
Tab. 2 Mann-Whitney U test for low temperature tolerance of N. albiflora of different genetic sexes
参数 样本数 平均值 标准差 最小值 最大值 百分位数 percentile
index sample size mean SD min max 25% 50% 75%
存活时间/h 200.00 63.59 26.50 0.00 120.00 52.50 68.00 74.00
survival time
曼-惠特尼 U 4 867
Mann-Whitney U
威尔科克森 W 10 972
Wilcoxon W
Z 0.210
渐近显著性(双尾) 0.834
asymptotic significance (two-tailed)
存活时间中位数/h 雄性 male 68.00
median survival time
雌性 female 70.00

https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
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