Page 51 - 《水产学报》2025年第6期

金鲟，等 水产学报, 2025, 49(6): 069604

表 4 GWAS 分析的候选基因及功能注释
Tab. 4 Candidate genes and function annotation of GWAS
染色体 起始位点/bp 终止位点/bp 候选基因 编码蛋白 功能注释
SNP chromosome gene gene candidate coding fuction
no. initiation site termination site gene protein annotation
24 742 779 chr5 24 743 748 24 743 927 GBF38_015680 hypothetical protein
14 709 088 chr6 14 684 492 14 692 800 MCAM.2 cell surface glycoprotein MUC18 促进血管生成
14 698 727 14 710 497 CBL.3 E3 ubiquitin-protein ligase CBL EGFR介导的信号转导的调节因子
MAP激酶活性的负调控
14 730 015 14 733 699 GBF38_012354 hypothetical protein
14 711 118 14 729 571 CBL.2 E3 ubiquitin-protein ligase CBL 细胞黏附的过程调控
加工蛋白质泛素化
泛素蛋白连接酶活性
1 198 510 chr14 1 208 705 1 209 769 PAQR8 membrane progestin receptor beta 核类固醇受体活性
~ 信号受体活性
1 198 531 类固醇结合蛋白
1 223 151 1 224 355 IL17F interleukin-17F 适应性免疫反应
对革兰氏阴/阳性细菌的防御反应
炎症应答
转化生长因子受体信号通路的调控
1 187 046 1 204 357 GBF38_005762 hypothetical protein
1 228 416 1 230 699 STMN4 stathmin-4 微管聚合或解聚的调控
1 177 523 1 183 369 PENK proenkephalin-A 疼痛感知和对压力的反应
细胞对cAMP的反应(蛋白激酶A)
细胞对氧化应激的反应
7 057 732 chr15 7 050 490 7 053 563 STOML2.2 stomatin-like protein 2 线粒体钙离子跨膜转运
线粒体DNA复制的正向调控
质子动力驱动的线粒体ATP合成
T细胞受体信号通路
11 990 810 chr22 11 945 434 11 949 757 SLC37A3 sugar phosphate exchanger 3 跨膜转运蛋白活性
碳水化合物运输
12 039 243 12 040 259 CDKN1B.2 cyclin-dependent kinase inhibitor 1B 周期蛋白依赖性丝氨酸/
苏氨酸激酶抑制剂活性
蛋白磷酸酶结合
细胞对缺氧的反应

白活性，能提升碳水化合物运输速率，故推测， 选择标记密度覆盖、提高表型测量准确度和优
STOML2.2 和 SLC37A3 极有可能在黄姑鱼低温 化实验等方法，进一步提高候选定位的精准性。
胁迫的能量响应中发挥着重要作用。根据注释 通过转录组差异性表达、基因编辑技术或表观
结果，MCAM.2 [72-73] 编码的蛋白能促进血管生成， 遗传学等手段对定位到的候选位点和基因进行
IL17F [74-75] 编码的蛋白能对革兰氏阴/阳性细菌 功能性验证，从而更好地解析黄姑鱼耐低温遗
做出防御反应，而 CBL.2 编码蛋白具有泛素化 传调控机制。

功能，能调动损伤蛋白降解 、催化酶活性功
[76]
[79]
能 、传递信号 [78] 和介导损伤修复 ，推测它 4 结论
[77]
们在低温胁迫下的防御修复中发挥着重要作用。
虽然基于 GWAS 分析定位到了多个候选基 基于黄姑鱼重测序获得的 SNPs 数据，定
因，但 GWAS 分析的效果受多种因素影响 [80] ， 位到 9 个与耐低温时长显著相关的位点，共注
故黄姑鱼具体低温胁迫响应通路还需要更多的 释到了 13 个候选基因。通过功能注释发现，
证据链去诠释。同时由于本研究所用的黄姑鱼 CBL.3、 PAQR8、 STMN4、 PENK 和 CDKN1B.2
属于同一批次繁育，因此导致能够获得的候选 与应激反应相关，STOML2.2 和 SLC37A3 与线
位点数目较少，且定位到的候选位点和基因有 粒体能量代谢有关，MCAM.2、CBL.2 和 IL17F
待进行进一步的筛查和验证。未来期望通过扩 与免疫及防御修复相关。综合分析发现，CBL.3、
大实验群体规模、筛选地方与野生群体、增加 STOML2.2 和 SLC37A3 等基因可能在调控黄姑

中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries https://www.china-fishery.cn
7