Page 50 - 《水产学报》2025年第6期
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金鲟,等                                                                  水产学报, 2025, 49(6): 069604


                   表 3    耐低温  GWAS  显著相关的    SNP  位点          温时长进行了全基因组关联分析,鉴定出多个
                    Tab. 3    SNPs significantly associated with  候选  SNPs 位点和候选基因,表明黄姑鱼的低
                   low temperature tolerance related in GWAS   温耐受性可能受多基因控制。通过对上述候选
                  性状         染色体编号         位置/bp     P 值       基因进行注释分析发现,候选主要与免疫、防
                  traits   chromosome number  position  P-value
                                                               御修复、压力应激及线粒体相关的能量代谢等
                耐低温            chr5       24 742 779  1.95×10 −7
                cold tolerance                                 过程相关。
                               chr6       14 709 088  4.30×10 −7
                               chr14       1 198 510  1.73×10 −6   其中候选基因        CBL.3  编码的   E3  泛素-蛋白
                               chr14       1 198 526  9.51×10 −8  连接酶已被多次报道在生物抵御外界逆境环境
                               chr14       1 198 531  1.73×10 −6                [66]
                                                               中发挥正调控作用 ,能通过钙信号系统抑制
                               chr15       7 057 732  1.56×10 −6
                                                               促分裂原活化的蛋白激酶              (MAPK) 信号途径的
                               chr18       2 856 391  4.61×10 −8
                                                               调控表达     [67-68] ,增强对逆境信号的感知,有利
                               chr22      11 990 810  1.98×10 −6
                               chr23       1 750 336  1.59×10 −7  于抵御低温胁迫环境。候选基因               STOML2.2  的
                                                               编码蛋白被报道能促进线粒体               DNA  复制,增进
              析,排除了生长和性别对黄姑鱼耐低温性状的                             质子动力驱动型         ATP  合成   [69-70] 。Meng  等  [71]  研
              影响。基于重测序获得的               SNPs 数据,对耐低            究表明,SLC37A3      编码的蛋白具有跨膜转运蛋

                          8

                      负 P 值常数对数  −lg(P)  6 4 2








                          0
                             1  2  3  4  5  6   7  8  9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24
                                                          染色体
                                                         chromosone


                            7
                        负 P 值常数对数  −lg(P)  5         基因-GBF38_015680
                            6
                            4
                            3
                                                     gene-GBF38_015680
                            2
                            0 1
                      起始位点                                                                   终止位点
                      24.693 Mb                                                              24.793 Mb
                     initiation site                                                        termination site
                      24.693 Mb                                                              24.793 Mb


                                                      chr5 范围: 99.96 kb
                                                      chr5 region: 99.96 kb



                                                                               LD 相关性
                                                                              LD correlation
                                                                       0                   1.0
                                      图 4    5  号染色体  GWAS  分析的候选基因    LDblock  注释图
                         Fig. 4 LDblock annotation of candidate genes from GWAS analysis on chromosome 5 (chr5)

              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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