Page 50 - 《水产学报》2025年第6期
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金鲟,等 水产学报, 2025, 49(6): 069604
表 3 耐低温 GWAS 显著相关的 SNP 位点 温时长进行了全基因组关联分析,鉴定出多个
Tab. 3 SNPs significantly associated with 候选 SNPs 位点和候选基因,表明黄姑鱼的低
low temperature tolerance related in GWAS 温耐受性可能受多基因控制。通过对上述候选
性状 染色体编号 位置/bp P 值 基因进行注释分析发现,候选主要与免疫、防
traits chromosome number position P-value
御修复、压力应激及线粒体相关的能量代谢等
耐低温 chr5 24 742 779 1.95×10 −7
cold tolerance 过程相关。
chr6 14 709 088 4.30×10 −7
chr14 1 198 510 1.73×10 −6 其中候选基因 CBL.3 编码的 E3 泛素-蛋白
chr14 1 198 526 9.51×10 −8 连接酶已被多次报道在生物抵御外界逆境环境
chr14 1 198 531 1.73×10 −6 [66]
中发挥正调控作用 ,能通过钙信号系统抑制
chr15 7 057 732 1.56×10 −6
促分裂原活化的蛋白激酶 (MAPK) 信号途径的
chr18 2 856 391 4.61×10 −8
调控表达 [67-68] ,增强对逆境信号的感知,有利
chr22 11 990 810 1.98×10 −6
chr23 1 750 336 1.59×10 −7 于抵御低温胁迫环境。候选基因 STOML2.2 的
编码蛋白被报道能促进线粒体 DNA 复制,增进
析,排除了生长和性别对黄姑鱼耐低温性状的 质子动力驱动型 ATP 合成 [69-70] 。Meng 等 [71] 研
影响。基于重测序获得的 SNPs 数据,对耐低 究表明,SLC37A3 编码的蛋白具有跨膜转运蛋
8
负 P 值常数对数 −lg(P) 6 4 2
0
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24
染色体
chromosone
7
负 P 值常数对数 −lg(P) 5 基因-GBF38_015680
6
4
3
gene-GBF38_015680
2
0 1
起始位点 终止位点
24.693 Mb 24.793 Mb
initiation site termination site
24.693 Mb 24.793 Mb
chr5 范围: 99.96 kb
chr5 region: 99.96 kb
LD 相关性
LD correlation
0 1.0
图 4 5 号染色体 GWAS 分析的候选基因 LDblock 注释图
Fig. 4 LDblock annotation of candidate genes from GWAS analysis on chromosome 5 (chr5)
https://www.china-fishery.cn 中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries
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