Page 39 - 《水产学报》2025年第5期
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瞿才惠，等                                                                 水产学报, 2025, 49(5): 059103

              叉尾鮰 、鲢       [34]  等鱼类相同。许氏平鲉二核苷                 最为常见，有       65 885  个位点，占二核苷酸总数
                     [10]
              酸数量共     247 744  个，重复基元以       AC/GT  为主，       的  26.59%；褐菖鲉二核苷酸重复基元主要集中
              有  147 630  个，占二核苷酸重复基元的             59.59%；     在  6~11  次，以重复    6  次最为常见，有       69 393  个
              CG/CG  重复基元最少，仅有            179  个，占二核苷          位点，占二核苷酸总数的              25.5%。因此，该研
              酸重复基元的        0.72%。褐菖鲉二核苷酸数量共                   究中两种鱼类微卫星重复单元的重复次数主要
              272 148  个，重复基元以      AC/GT  为主，有     157 437    分布在    6~12  次，随着重复次数的增加，对应位
              个，占二核苷酸重复基元的               57.85%；CG/CG   重      点总数呈递减的趋势。

              复基元最少，仅有           166  个，占二核苷酸重复基
                                                               3.4    微卫星序列长度及变异分析
                                        [7]
              元的   0.67%。在斑点叉尾鮰 中            AC/GT  为主要
              基元，占二碱基微卫星重复总数的                   58%，与许             随着微卫星序列扩增长度的增加，两种鱼
              氏平鲉和褐菖鲉结果一致。王九龙等                      [35]  认为   类核苷酸出现的频次整体呈逐渐下降的趋势。
              DNA  复制过程中发生滑移错配而使重复单元的                          许氏平鲉微卫星序列长度分布于                10~392 bp，平
              重复次数发生变化，而            DNA  复制发生滑移错配              均长度为     34.59 bp，序列长度为       12 bp  的微卫星
              的概率与序列的         GC  含量成反比。这可能是因                  位点数量最多，为           55 599  条，占总位点数的
              为  C/G  碱基之间通过       3  个氢键连接，而       A/T  之     15.83%。褐菖鲉微卫星序列长度分布于                 10~682
              间只有    2  个氢键，GC     含量高的      DNA  序列需要         bp，平均长度为       36.87 bp，序列长度为       12 bp  的
              更多能量打开双链而不易发生滑动，因此，微                             微卫星位点数量最多，为             55 942  条，占总位点
                                               [36]
              卫星中    GC/CG  类型的发生频率较低 。                        数的   15.66%；其次为长度         10 bp  的位点，为
                   两种鱼类微卫星不同重复类型的含量差别                          51 744  条，占总位点数的         14.79%。研究表明，
              不大，都以二碱基微卫星占优势，其次是单核                             除二碱基和三碱基重复拷贝数有轻微波动外，
              苷酸，其余       4  种碱基类型微卫星含量较少。在                    6  种碱基类型的总体变化特点，就是随着重复
              已发表的全基因组微卫星特征的研究中，军曹                             拷贝数的增加，各类别微卫星的数目逐渐递减，
              鱼  (Rachycentron canadum) (50.5%)、暗纹东方           以上这种现象在黄颡鱼 、绿鳍马面鲀                     (Tham-
                                                                                     [45]
              鲀   (Takifugu  obscurus)  (47.72%)、 鲤  (Cyprinus  maconus  modestus) 、 中 国 花 鲈    (Lateolabrax
                                                                                [35]
              carpio) (59.19%) 等全基因组中单碱基微卫星数                   maculatus) 、红鳍东方鲀       (T. rubripes) [46]  等物种
                                                                        [4]
              目最多     [33,37-38] ，南极鱼  (Patagonotothen ramsayi)                                          [47]
                                                               全基因组微卫星中也有出现。对此，Wierdl 等
              (87.00%)、 绒 杜 父 鱼      (Hemitripterus  villosus)  认为，一方面微卫星长度与微卫星稳定性有关，
              (55.61%)、花斑无须鲇         (Ageneiosus marmoratus)
                                                               即随微卫星长度的增加，其稳定性下降；另一
              (43.24%)、金钱鱼      (Scatophagus argus) (52.64%)   方面，微卫星的突变率与其重复拷贝数呈正相
              等以二碱基微卫星数目占优势                [31,39-42] 。因此，不
                                                               关，即微卫星重复拷贝数越高，突变率就越大，
              同物种的优势微卫星类型存在差异。
                                                               使得越长的微卫星序列数目越少。


              3.3    微卫星基元重复次数分析
                                                               4    结论
                   从许氏平鲉核苷酸重复次数来看，核苷酸
              基元重复次数主要集中在               5~17  次，6  次最多，            本研究对许氏平鲉和褐菖鲉两种卵胎生鱼
              有  91 669  个位点，占总数的        17.66%；褐菖鲉核           类全基因组微卫星含量、微卫星重复类型、微
              苷酸重复基元以          5  次最多，有     92 776  个位点，
                                                               卫星基元重复次数、微卫星序列长度及变异等
              占总数的     16.72%。黄纬杰      [29]  研究发现，草鱼核
                                                               四个方面进行了比较分析，为深入开展鱼类种
              苷 酸 基 元 重 复 次 数 以      10  次 为 主 ， 占 总 数 的
                                                               质资源研究及遗传育种等提供了数据支持。
              23.23%，与许氏平鲉和褐菖鲉结果存在差异。
              许氏平鲉和褐菖鲉单核苷酸重复次数以                      10~14
              次 为 主 ， 草 鱼 单 核 苷 酸 重 复 次 数 最 多 ， 以                  感谢浙江海洋大学刘焘和武汉万摩科技有
              10~29  次为主   [43] ，鲌亚科   (Culterinae) 鱼类  [44]  单  限公司刘启在数据分析和论文撰写方面的帮助。
              核苷酸重复次数以           10~24  次为主，单核苷酸重
              复次数大于许氏平鲉和褐菖鲉。许氏平鲉二核                             参考文献     (References)：
              苷酸重复基元主要集中在              6~12  次，以重复     6  次   [  1  ]   Tautz  D.  Hypervariability  of  simple  sequences  as  a  general

              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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