Page 38 - 《水产学报》2025年第5期
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瞿才惠,等 水产学报, 2025, 49(5): 059103
35 35
30 30
25 25
频率/% frequency 20 频率/% frequency 20
15
15
10 10
5 5
0 0
10 12 14 16 18 20 22 24 12 16 20 24 28 32 36 40 44 48
SSR 序列长度 SSR 序列长度
length of SSR sequence length of SSR sequence
(a) (b)
45 45
40 40
35 35
30 30
频率/% frequency 25 频率/% frequency 25
20
20
15 15
10 10
5 5
0 0
15 18 21 24 27 30 33 36 39 42 45 48 51 20 24 28 32 36 40 44 48 52 56 60
SSR 序列长度 SSR 序列长度
length of SSR sequence length of SSR sequence
(c) (d)
60 60
50 50
40 40
频率/% frequency 30 频率/% frequency 30
20 20
10 10
0 0
25 30 35 40 45 50 55 60 65 70 30 36 42 48 54 60 66
SSR 序列长度 SSR 序列长度
length of SSR sequence length of SSR sequence
(e) (f)
图 4 褐菖鲉不同 SSR 重复单元预期扩增的序列长度变异
Fig. 4 Variation in sequence length of expected amplification of different SSR repeat units in S. marmoratus
12 835 407 bp,平均跨度为 1 329.43 bp ,平 能是不同物种基因组大小的差异造成的 ,也
[31]
[33]
均跨度小于许氏平鲉 (1 587.25 bp) 和褐菖鲉 可能有物种进化差异的原因 。
[30]
(1 392.60 bp)。翘嘴鲌 (Culter alburnus) [32] 微卫星
3.2 微卫星基元类型特征分析
总长度占全基因组大小的 1.35%,小于许氏平
鲉 (1.67%) 和褐菖鲉 (1.99%) 中微卫星在全基因 许氏平鲉单核苷酸数量共 165 455 个,褐
组中的含量。这些结果表明,不同物种的微卫 菖鲉单核苷酸数量共 187 994 个,两种鱼中单
星数量在全基因组中的含量存在明显差异,可 核苷酸重复基元以 A/T 为主,这一结果与斑点
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