Page 167 - 《水产学报》2025年第5期
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车行,等 水产学报, 2025, 49(5): 059114
ORF 模块 (ORFA 和 ORFB) 组成,ORFB 编码 ICESag1535 核心元件的菌株共 78 株,分别为
位置相对 ORFA 分别具有 (−1 bp) 和 (+1 bp) 的 2014—2016 年收集的 26 株,2020—2021 收集
移码特征,当转座被激活时,ORFB 发生程序 的 52 株,核心元件的携带率分别为 78.8% 和
化移码,使 ORFA 和 ORFB 处于同一阅读框中, 96.3%。在所有具有 ICEs 核心元件的菌株中,
形成融合蛋白 ORFAB,成为具有活力的转座酶 同时检出 Ser IME 、Ser 、Ser 和 Ser 的有 76 株,
M
I
E
。而 IS982 复合转座子中仅 3′端的 IS982 具有 IME
[25] 2 株具有 ICE 核心元件的菌株未检出 Ser ,
转座活力。此外,7 个 IS 元件的 C-端皆具有 可能使用其他类型的重组酶。
DDE 特征性基序,TSPSI 和多复合转座元件同 2.8 ICESag1535 水平转移验证
时存在可介导 ICE 形成的多种水平转移机制。
根据细菌表面荚膜多糖的不同,无乳链球
2.6 ICESag1535 同源性比较 菌可分为不同的血清型。WC1535 为 Ⅰa 血清
型,cpsG 引物扩增产物为 272 bp,而 Sag158
Tn5252 是链球菌属最早被鉴定的接合型转
为Ⅲ型血清型,cpsG-3 扩增产物为 352 bp。通
座子,此后,不同来源的 Conj Tn5252 型 ICEs 不
过接合实验成功获得 ICESag1535 转入 Sag158
断被报道 。ICESa2603 家族 ICEs 以人无乳链
[26]
的接合子 Sag158::ICESag1535,引物 attICE 检
球菌株 2603V/R 编码的 ICE_Sag2603_rplL 为代
测到了环状中间体 (图 6)。
表,具有 30 个骨架基因 (图 5,ICESa2603 中黑
接合子中 ICESag1535 插入在受体菌 Sag158
[27]
色、蓝色、灰色箭头所示) ,属于 Conj Tn5252 基因组 mutT 基因内,测序发现接合子 attL 和
型接合模式。ICE_SsuT15_mutT 来自猪链球菌
attICE 位点与 WC1535 上完全相同,但在 attR
[28]
T15 ,缺失 AbiEii/AbiGii 蛋白,与 ICESag1535
的测序结果中发现 1 537 bp 的插入元件 IS30 位
都编码三串联丝氨酸整合酶;根据 ICEs 结构组
于 Ser 终止密码后 (+3 bp) 处,并使插入位点
E
成,ICESag1535 和 ICE_SsuT15_mutT 都鉴定为
前 14 bp 序列形成重复,分别位于 IS30 两端
[29]
类 ICESa2603 型 ICEs ,接合模式为 Conj
Tn5252 (图 6-f),比对发现在 WC1535 和 Sag158 基因组
型。这种接合模式的 ICEs 存在于多种微生物内,
上其他位置存在与 IS30 完全相同的拷贝。
且结构保守,具有种间扩散能力。
3 讨论
2.7 ICESag1535 在 罗 非 鱼 无 乳 链 球 菌 中 的
检测
类 ICESa2603 家族的 ICEs 被大量报道,
87 株 罗 非 鱼 源 无 乳 链 球 菌 中 , 具 有 编码 Conj 型接合元件,可发生跨种扩散,
Tn5252
Tn5252
٫က৽౯ऩ 20 000 40 000 60 000
S. pneumoniae
(48 559 bp) tyR
ICESa2603 repA
无乳链球菌
S. agalactiae
(54 792 bp) tyR int
ICE_Sag1535_mutT repA
无乳链球菌
S. agalactiae
(74 108 bp) repA Ser I int Ser E int
Ser M int
ICE_SsuT15_mutT
猪链球菌 S. suis
(56 097 bp) repA Ser I int Ser E int
Ser M int
图 5 ICESag1535 比对示意图
比例示意图,ICESag1535 与无乳链球菌 ICESa2603、肺炎链球菌中 Tn5252 、猪链球菌 T15 中的 ICE_SsuT15_mutT 线性比对。Conj Tn5252 家
族的 25 个保守核心基因用黑色箭头指示,灰色箭头表示转座酶和整合酶,绿色箭头表示抗性基因,4 个 ICEs 之间的同源基因分别用蓝色
箭头表示,同源区域用灰色阴影表示。
Fig. 5 Schematic diagram of the ICESag1535 and linear DNA comparison
Schematic, but to scale, representation of ICESag1535 and linear DNA comparison against ICESa2603 from S. agalactiae 2603V/R and fragments of
Tn5252 from S. pneumoniae and ICE_SsuT15_mutT from S. suis T15 strain. The 25 conserved core genes of the Conj Tn5252 family are indicated by black
and dark gray arrows, green arrow indicate antibiotic gene, blue arrows indicate homologous genes, homologous regions are shaded in gray.
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