Page 165 - 《水产学报》2025年第5期
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车行,等 水产学报, 2025, 49(5): 059114
5′-GGCCATATTGAAGAAGGAGA-3′
mutT attB
5′-CAGTTACTTGACATGAGG-3′ 5′-GGGATTGTCATAATAATG-3′
attICE attL RepA
attR
Ser E Int
Ser M Int
Ser I Int
ICESag1535 cicular
oriT: 5′-GGGATATTGTGGACACAATATCTGAGCTCG CAAAAGCC-3′
oriT
图 2 attL、attR、oriT 与 ICESag1535 在基因组上的识别位点 attB
attB、attICE、attL、attR 位点和推测的 att 序列标注于图中;oriT 位点如图所示,序列下方的箭头表示反向重复的位置,垂直的箭头表示
切开缺口的位置。
Fig. 2 The recognition site attB of attL, attR, oriT and ICESag1535
The attB, attICE, attL, attR sites and the putative att sequence were indicated, the oriT site as shown as in the Fig, arrows under the sequence represent
the locations of inverted repeats, and the vertical arrows show the nick sites.
中 都 含 有 典 型 的 SR_TndX_transposase domain carifer) 和尼罗罗非鱼,它们编码的 TSPSI 几乎
(图 3),此模块兼具解离酶 (resolvas)、转化酶 完全相同 (图 4),插入位点全部为 mutT 基因,
(invertase)、整合酶 (integrase) 和 转座酶 (trans- 表明本研究中发现的类 ICESag1535 已在全球范
posase) 功能,并调节 DNA 切除和环化,辅助 围分布。
松弛蛋白的功能 [21] 。Recombinase domain 在微 两个相同类型的 IS 可组成复合型转座子,
生物和噬菌体中常与 resolvase domain 联合出现, 对夹在其间的 DNA 进行转座 [24] 。ICESag1535
[22]
形成催化活性位点 。Zn_ribbon_recom domain 可变区包含 7 个 IS 元件,形成 3 个复合型转座
在位点特异性重组酶中为简化的 Zn-binding 结 子 (图 1),分别为 2 个对向排列的 IS3 中间夹着
构域,激活转录蛋白活性 。以 ICESag1535 编 的细菌素转运酶插入在基因间隔区,2 个对向
[23]
码的 TSPSI 为质询序列,通过 Blast 搜索 NCBI 排列的 IS982 连同中间夹着的多个基因插入在
数据库,发现有 8 个水生动物源无乳链球菌菌 Abi 基因内,2 个同向排列的 IS630 夹着核苷酸
株存在与 ICESag1535 相似的未鉴定 ICE 序列, 转移酶插入在 IS982 复合转座子内。分析 IS 的
分布位置跨北美洲到亚洲,细菌宿主包含美洲 结构发现,每个 IS3 和每个 IS630 皆具有转座
牛蛙 (Lithobates catesbeiana)、尖吻鲈 (Lates cal- 对应的复合转座子能力,IS3 和 IS630 由 2 个
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