Page 166 - 《水产学报》2025年第5期
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车行,等                                                                  水产学报, 2025, 49(5): 059114


                                                 表 2    可变区主要蛋白及功能
                                          Tab. 2    Function of proteins in variable regions
                     功能分区                    蛋白描述                                 主要功能
                    functional area       proteins description                    function
                       DⅠ              AbiEii/ AbiGii 毒性蛋白家族        维持 ICE 稳定,防止脱落
                       DⅡ              凝集素受体                        黏附、识别和位置调节等
                                       LPXTG 锚定蛋白
                                       滑动调节脂蛋白CglD
                       DⅢ              FAD依赖性氧化还原酶                  参与氧化还原与应激调节
                                       类rhodanese主要结构域蛋白
                                       金属敏感性转录调节因子
                                       依赖性氧化还原酶
                       DⅣ              AcrR家族转录调节蛋白                 微菌素 C7 生成转录与转运
                                       ThiF家族腺苷转移酶
                                       羊毛硫细菌素转座透性酶
                                       羊毛硫细菌素转座透性酶
                       DⅤ              ABC转运ATP绑定蛋白                 ABC 物质运输与代谢
                                       ABC转运透性酶
                                       ABC转运ATP绑定蛋白
                                       ATP绑定蛋白
                                       CAAX 氨基酸蛋白酶,Abi
                       DⅥ              AAA-10 ATP绑定蛋白               T4SS 同源蛋白,分别与VirB 4 、VirB 6  和 VirB 1  同源
                                       接合转移蛋白TrbL
                                       噬菌体溶菌酶
                       DⅦ              Cna B型胶原绑定蛋白                 细菌黏附和物质转运
                                       ABC绑定蛋白
                                       ABC_DR蛋白
                                       ABC转运透性酶


                             1         250       500       750      1 000     1 250      1 500
                                                                                               bp
                                  SR TndX 转座酶             重组酶      锌绑定结构域
                                 SR_TndX_transposase    recombinase  Zn_ribbon_recom
                         Ser I  Int
                                    SR TndX 转座酶            重组酶
                                   SR_TndX_transposase    recombinase
                        Ser M  Int
                                  SR TndX 转座酶            重组酶      锌绑定结构域
                                 SR_TndX_transposase   recombinase  Zn_ribbon_recom
                        Ser E  Int
                                                图 3    三串联丝氨酸整合酶结构
                          Fig. 3 The conserve domains distribution in the triplet of site-specific serine recombinases

                                                        `S. agalactiae WC1535 (尼罗罗非鱼 O. niloticus, 中国)

                                                无乳链球菌                          `
                                                        `S. agalactiae STIR-CD-21 (美洲牛蛙 L. catesbeiana, 美国)
                                                无乳链球菌                        `
                                                        `S. agalactiae STIR-CD-22 (尼罗罗非鱼 O. niloticus, 美国)
                                                无乳链球菌                             `
                                                        `S. agalactiae KKN 3/1(L) (尼罗罗非鱼 O. niloticus, 日本)
                                                无乳链球菌                            `
                                             100
                                                        `S. agalactiae FNA07 (尼罗罗非鱼 O. niloticus, 泰国)
                                                无乳链球菌                         `
                                                        `S. agalactiae 14-107 (尼罗罗非鱼 O. niloticus, 加拿大)
                                                无乳链球菌                         `
                                                        `S. agalactiae SBVN (尖吻鲈 L. calcarifer, 越南)
                                                无乳链球菌                      `
                                                        `S. agalactiae 3896VN (尼罗罗非鱼 O. niloticus, 越南)
                                                无乳链球菌                          `
                                                        `S. agalactiae ENC06 (尼罗罗非鱼 O. niloticus, 泰国)
                                                无乳链球菌                         `
                                                   `S. suis T15 (猪 Sus scrofa, 中国)
                                             猪链球菌            `
                                                猪链球菌 S. suis 20091101-1 (猪 S. scrofa, 中国)
                                                                       `
                                                        `
                        0.020
                                           图 4    三串联丝氨酸整合酶的系统发育分析
                                Fig. 4 Phylogenetic analysis of the triplet of site-specific serine integrases
              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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