Page 127 - 《水产学报》2023年第1期
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郑卫卫,等 水产学报, 2023, 47(1): 019109
酸化和去磷酸化作用逐级放大并传递细胞膜表面 moides) 和虹鳟 (Oncorhynchus mykiss) 中被报道 。
[17]
受体接收到的外界刺激信号,从而激活效应蛋白, Yu 等 [17] 在大黑口鲈基因组中鉴定出 8 个 MKK 基
触发应激反应和免疫调节等细胞反应 [2, 5-6] 。 因家族成员,其中 MKK2、5、6、7 在冷胁迫后呈
作为级联反应的核心枢纽,MKK 蛋白序列 现差异表达。Yang 等 [18] 在虹鳟中共鉴定出 17 个
具有保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域 (S_ MKKs,其中 MKK2、MKK4b3、MKK6s 对鳗弧菌
TKc)、DVD 结构域及多个亚结构域,如双磷酸化 感染具有较强的响应。
位 点 (S/TxxxS/T)、 GxGxxGxV motif (参 与 MKK 大菱鲆 (Scophthalmus maximus,FishBase ID:
和 MAPK 之间的磷酸转移反应)、AxK motif (对 1348) 是具有重要经济价值的冷水性海洋比目鱼类,
ATP 的锚定和定向有重要作用)、HRDxKSPN motif 味道鲜美,营养价值高,目前已成为世界年养殖
(位于 MKKs 的催化环中,是接受底物羟基质子的 产量最高的鲆鲽鱼类之一 。近年来,由于高密
[19]
催化基序)、DFG/APE motif (调节 ATP 和 MKK 的 度集约化养殖规模的不断扩大以及气候变暖等极
相互作用)、DxWxxG (稳定催化环) 等。作为双特 端天气事件频发等,大菱鲆正面临着多种生物和
异性激酶,MKKs 可以整合来自上游 MKKKs 的 非生物应激的胁迫,如病原菌感染 [20-22] 、热应激 、
[23]
[7]
信 号 并 激 活 下 游 MAPKs , 即 上 游 磷 酸 化 的 低氧应激 、盐度胁迫 [25] 等,极大地阻碍了大菱
[24]
MKKKs 通过 MKKs 中的双磷化位点将 MKKs 磷 鲆养殖产业的健康和可持续发展。鉴于 MKKs 在
酸化并激活,同时,激活的 MKKs 又通过磷酸化 响应各种应激胁迫中的作用,对大菱鲆 MKK 基
[8]
MAPK 激活环中的 T-X-Y motif 从而激活 MAPKs 。 因家族进行系统地鉴定并对其进行功能分析具有
近年来,MKK 基因家族全基因组水平的鉴 重要的现实意义。因此,本研究对大菱鲆 MKK
定及其在响应生物和非生物应激中的作用已在多 基因家族进行了全基因组水平的鉴定,并对其理
种植物中被报道 [9-13] 。在小麦 (Triticum aestivum) 中 化性质、系统发育关系、基因结构和保守基序等
共鉴定出 18 个 MKK 基因家族成员,转录组数据 进行了分析。另外,基于多个已公开的应激相关
分析表明,MKKs 在响应热、冷、干旱、盐度等 的大菱鲆转录组数据集,研究了 MKKs 在不同组
[9]
多种非生物胁迫中发挥重要作用 。Song 等 [10] 在 织以及不同生物和非生物胁迫下的表达模式。这
西瓜 (Citrullus lanatus) 中鉴定出 6 个 MKKs,分析 可能是首次对大菱鲆 MKK 基因家族进行系统的
表明,大部分 MKK 家族成员对生物应激如西瓜 鉴定和功能研究。本研究结果将为研究大菱鲆
枯萎病菌 (Fusarium oxysporum f. sp. niveum) 感染 MAPK 基因家族在响应各种生物和非生物应激中
和非生物应激如干旱、盐度、冷和热处理等均有 的作用提供新的见解,为大菱鲆综合抗逆分子选
较 强 的 响 应 。 Liang 等 [11] 在 欧 洲 油 菜 (Brassica 择育种研究提供重要的理论基础。
napus) 中共鉴定出 7 个 MKK 基因,实时荧光定
量 PCR(qRT-PCR) 分析表明,其中 4 个家族成员 1 材料与方法
对冷、乙二酸、水杨酸、核盘菌 (Sclerotinia scler-
1.1 大菱鲆 MKK 基因家族鉴定及理化性质分析
otiorum) 等应激中的至少一种应激具有响应。另
外,大量研究表明 MKK 基因家族在水生动物响 在 NCBI 数 据 库 下 载 大 菱 鲆 基 因 组 序 列
[26]
应环境胁迫中也发挥着重要作用 [8, 14-16] 。如 Zou 等 [8] (GCA_022379125.1) 、基因组注释 (GTF) 文件、
对虾夷扇贝 (Patinopecten yessoensis) MKK 基因家 蛋 白 序 列 文 件 , 在 UniProt 数 据 库 下 载 斑 马 鱼
族进行了全基因组水平鉴定并分析了其在细菌 (Danio rerio)、 青 鳉 (Oryzias latipes) 和 斑 点 雀 鳝
感染后的表达模式,研究表明,所有 5 个家族成 (Lepisosteus oculatus) MKK 氨基酸序列。以斑马
员 在 藤 黄 微 球 菌 (Micrococcus luteus) 和 鳗 弧 菌 鱼 MKK 氨 基 酸 序 列 作 为 查 询 数 据 库 , 使 用
(Vibrio anguillarum) 感染后均表现出显著差异表达。 BLASTP (E-value < 1e-10) 对大菱鲆基因组进行搜
另外,Fan 等 [15] 克隆了一个斑节对虾 (Penaeus mon- 索,得到候选的大菱鲆 MKK 氨基酸序列,然后
odon) MKK 基因,该基因在哈维氏弧菌 (V. har- 分别利用 SMART、NCBI CDD 和 HMM search 进
veyi) 和鳗弧菌感染及低盐胁迫下均表现出显著上 行结构域分析,将具有 MKK 基因家族特有保守
调或下调。然而有关硬骨鱼 MKK 基因家族的系 结构域 (S_TKc) 的序列作为最终的大菱鲆 MKK
统鉴定和功能研究只在大黑口鲈 (Micropterus sal- (SmMKKs) 蛋白序列。然后,利用 ExPASy Prot-
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