Page 57 - 《中国药科大学学报》2026年第2期
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第  57 卷第  2 期                  冉靖芝,等:毒品原植物       DNA  鉴定方法研究进展                             183

               生变异,则酶切图谱产生差异,从而实现序列多态                           短,实验结果易受影响,重复性较差。Tittarelli 等               [7]
               性检测。RFLP      标记呈共显性,能区分纯合体与杂                    针对缉获的不同年份罂粟果进行                RAPD  分析,采用
               合体,提供完整的遗传信息,且结果稳定、重复性                           3 组不同引物进行        PCR  扩增,均获得相同的扩增条
               好,适用于遗传连锁图谱构建。然而,该技术操作                           带,表明所测样品具有相同的基因。
               烦琐、检测周期长、样本需求量大、难以自动化且                            1.2.3 序列特异扩增区域标记技术 序列特异扩
               灵敏度较低,目前多与其他技术结合使用。                              增区域标记(sequence characterized amplified region,
                1.2    基于  PCR  技术的分子标记                         SCAR)是在     RAPD  的基础上,将其筛选出的特异
                    基于  PCR  技术的分子标记是目前应用最广泛                    性条带进行回收、克隆和测序,根据所得序列在原
               的  DNA  标记类型。其核心原理是利用                PCR  特异     RAPD  引物基础上延长约          10 个碱基,重新设计特
               性扩增基因组中的特定片段,再通过电泳或测序分                           异性引物,扩增后检测基因组中对应的单一位点。
               析扩增产物的多态性,以实现物种鉴定或基因分型。                          SCAR  标记操作简便、快速可靠,适用于大规模样
               根据引物设计策略、扩增特征及检测方法的差异,                           本检测;因其引物特异性强,与模板结合更稳定,结
               基于   PCR  的分子标记可进一步分为多种类型,下文                     果重复性高、专一性好,广泛应用于辅助育种和遗
               将介绍    4 种代表技术的原理、特点及应用进展。                       传图谱构建等领域。Zhao 等 利用               RAPD  筛选出
                                                                                          [8]
                1.2.1 酶切扩增多态性序列标记技术 酶切扩增多                       多对,在雌雄间具有显著差异的引物,将多态性明
               态性序列(cleaved amplified polymorphic sequences,    显的   me11/em12 引物被转化为稳定的             SCAR  标
               CAPS,又称    PCR-RFLP)是在     RFLP  与  PCR  技术基     记,该标记能够在雄株中扩增出一条特异性条带,
               础上发展起来的一种分子标记方法。其通过特异                            而雌株中无此条带,表明其具有良好的性别鉴别
               性引物扩增目标         DNA  片段后,用限制性内切酶对                能力。
               扩增产物进行酶切,最后通过凝胶电泳和染色进行                            1.2.4 短串联重复序列标记技术 短串联重复序
               多态性分析。优点是           DNA  用量少、质量要求较低,             列(short tandem repeats,STR),又称微卫星     DNA  或
               结果稳定、准确性高,操作简便,易于自动化。然而,                         简单重复序列(SSR),是由          2~6 个核苷酸为重复单
               该方法依赖限制性内切酶,需筛选合适的酶组合,                           元组成的串联重复序列,广泛分布于真核生物基因
               且已知突变酶切位点有限,限制了大规模应用。                            组中。由于重复单元的重复次数在不同个体、不同
               CAPS  常用于植物多态性分析、基因分型及微生物                        物种间存在显著差异,根据其侧翼保守区设计特异
               多样性研究。在毒品原植物鉴定中,可针对差异酶                           性引物进行扩增,获得多态性片段,通过检测多个
               切位点设计引物,获得特异性条带以实现种属鉴                            STR  位点及形成基因,根据图谱差异实现物种鉴
               别。例如鉴定大麻亚种的研究,结果显示,工业大                           别、个体识别或地理溯源。STR               具有高度多态性、
                                                          [5]
               麻产生    2 条条带,而毒品大麻则产生          3 或  4 条条带 。      数量丰富、长度变异显著等特点,是一种理想的遗
                1.2.2 随机扩增多态性        DNA  标记技术 随机扩增             传标记。STR      标记呈共显性;对         DNA  质量和用量
               多 态 性   DNA  标 记 ( random  amplified  polymorphic  要求低;重复性好、灵敏度高、易于标准化;等位基
               DNA,RAPD)于     1990 年提出 ,该技术使用一系列                因数量多、鉴别能力强,具有高度种属特异性,是法
                                         [6]
               8~10 bp 的随机序列引物,对基因组            DNA  进行非特        庭科学中最常用的遗传标记之一。
               异性扩增,扩增产物经凝胶电泳和染色后,分析                                 Xia 等  [9]  建立了一套包含     19 个位点的大麻
               DNA  条带的多态性来反映基因组差异。较短的引                         STR  分型系统,并基于        126 个样本中的常见等位基
               物与基因组      DNA  的结合位点具有随机性,一旦基                   因构建了等位基因分型标准物。该系统准确、灵
               因组扩增区域序列发生突变,会引起扩增产物长度                           敏,可实现大麻的物种鉴定、性别鉴定与个体识
               或数量的变化,而表现出多态性。该技术的优点是                           别。Borin 等   [10]  从  41 个大麻候选   SSR  中筛选出
               操作简便、检测速度快;对            DNA  质量和用量要求较            20 个高多态性位点,可有效评估种内和中间纯合
               低;不依赖物种特异性,同一套引物可适用于不同                           性、遗传一致性及遗传变异,构建出一套信息丰富、
               生物的全基因组分析。缺点是其为显性标记,无法                           可靠且可重复的多位点基因分型系统,适用于新品
               区分纯合体与杂合体,提供信息有限;同时引物较                           种选育辅助鉴定与市场品种身份确认。
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