Page 29 - 《渔业研究》2026年第2期
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172                                  渔  业  研  究                                     第 48 卷

              冻;对照组(Ae-CK)与各运输时间组(Ae-T)同                       物种间高度保守,PSI-BLAST          中  600  余个序列相
              步取样。当所有样品取样完毕后,统一置于−80 ℃                         似度均在     93%  以上。系统发育进化树结果如图               2
              冰箱内保存备用。                                         所示,辐鳍鱼类聚为一大分支,亲缘关系较近;哺

                       表 2    大眼双锯鱼模拟运输试验安排                    乳动物、鸟类、爬行动物、两栖动物聚为另一大分
                  Tab. 2    Arrangement of A. ephippium simulation  支,与辐鳍鱼类亲缘关系较远;辐鳍鱼类中,同目
                           transportation experiment           鱼类分别聚为一支,其中眼斑双锯鱼与大眼双锯鱼
                                                               关系最近。
                                 时间段 Time period
               组别
               Groups                                           2.2 HSPA8  蛋白理化性质预测
                      0~6 h   7~12 h  13~24 h  25~36 h  37~48 h
                                                                   对大眼双锯鱼       HSPA8  蛋白的理化性质进行
               Ae-T0 打包后立即取样
                                                               分析,结果表明,HSPA8        蛋白的分子式为       C 3117 H 5001
               Ae-T6 不间断运输                                            S ,预测的分子量大小约为              71.26 kDa,
                                                               N 863 O 1005 19
               Ae-T12 不间断运输 不间断运输                              理论等电点为       5.22。在组成蛋白质的        20  种常见氨
                                    静息  1 h、                   基酸中,含量最多的是甘氨酸(Gly) ,占比为                8.6%;
               Ae-T24 不间断运输 不间断运输 运输    1 h, 不间断运输
                                      循环                       其次是赖氨酸(Lys) ,占比为           8.0%;含量最少的
                                    静息  1 h、        静息  1 h、   是色氨酸(Trp) ,仅占        0.3%;该蛋白中不含稀有
               Ae-T48 不间断运输 不间断运输 运输    1 h, 不间断运输 运输  1 h,
                                      循环             循环        氨基酸;带负电荷的氨基酸(Asp+Glu)数量为
               Ae-CK 不进行运输操作                                   96,带正电荷的氨基酸(Arg+Lys)数量为               81。该
                                                               蛋白质的不稳定性指数为            35.16,归类为稳定蛋白
               1.9 数据分析                                        质。亲/疏水性预测结果(图             3)显示,HSPA8 蛋
                  试验数据均使用        SPSS 26.0  软件进行统计与分           白最大疏水值为        2.100,位于第     409  位氨基酸处;
              析,选择单因素方差分析法,采用新复极差法                             最小疏水值为−3.311,位于第          592  位氨基酸处;总
              (Duncan’s multiple range test)验证组间差异,数           平均亲疏水性为−0.464,表明该蛋白质为亲水性
              据用平均值±标准差表示,差异显著性水平设置为                           蛋白。
              P<0.05。柱状图由       GraphPad Prism 9.0  软件完成        2.3 HSPA8  蛋白的结构分析及亚细胞定位预测
              绘制。                                                  对大眼双锯鱼       HSPA8  蛋白的信号肽及拓扑结
               2 结果与分析                                         构进行预测,结果(图          4)表明,HSPA8      蛋白为胞
                                                               外蛋白,无信号肽序列,且没有跨膜结构域。
               2.1 HSPA8 基因克隆、相似性分析及其系统进化                          对  HSPA8  蛋白的亚细胞定位进行分析,结果
              树构建                                              (图  5)显示,HSPA8      蛋白主要定位于细胞质和细
                  测序结果通过比对,确认扩增产物为                HSPA8  基     胞核,并在这两个区域穿梭及发挥其分子伴侣功
              因  ORF。对克隆所得        HSPA8  的  CDS  进行分析并         能,还可能存在于细胞骨架、过氧化物酶体、线粒
              预测蛋白质序列,结果显示大眼双锯鱼                   HSPA8 基      体中及细胞外。与         UniProt 数据库中同属物种的亚
              因的   CDS  区全长   1 953 bp,编码氨基酸残基         650     细胞定位     GO  注释信息对比,大眼双锯鱼             HSPA8
              个(图    1) 。对大眼双锯鱼与眼斑双锯鱼的              HSP70s     蛋白的预测结果与数据库中同属物种注释结果基本
              家族基因     ORF  序列进行序列比对,结果(表               3)     一致。眼斑双锯鱼的          HSPA8  蛋白(主访问编号:
              表明,大眼双锯鱼         HSPA8  基因  ORF  及蛋白质序列          A0A3Q1CEV7,序列相似度为          100%)除了定位于
              长度与眼斑双锯鱼相等;大眼双锯鱼                  HSPA8  基因      细胞质和细胞核外,GO          注释还显示其可定位于细
              与眼斑双锯基因        ORF  相差  16  个碱基,序列相似度            胞质膜中。
              为  99.18%,蛋白质序列完全相同。由表                3  可知,      2.4 HSPA8  蛋白结构及功能预测
              大眼双锯鱼      HSPA8  蛋白与眼斑双锯鱼的序列相似                      对大眼双锯鱼      HSP70s 蛋白的二级结构进行分
              度 最 高 ( 100.00%) , 与 双 线 蚓 螈 ( Rhinatrema        析,结果(图      6)显示,HSPA8      蛋白主要由     α-螺旋
              bivittatum)序列相似度最低(93.97%) ,与人类                  (蓝色) 、β-折叠(紫色) 、β-转角(绿色)与无规
              和 斑 马 鱼 ( Danio  rerio) 的 序 列 相 似 度 分 别 为        则卷曲(橙色)4        部分组成,占比分别为           41.85%、

              95.11%  和  96.92%。整体来看,HSPA8      蛋白在不同          17.23%、3.38%、37.54%。
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