Page 17 - 《渔业研究》2026年第1期
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渔业研究 2026，48（1） ：14 − 23                                             http://www.hyyysci.com
                Journal of Fisheries Research                                     DOI:10.14012/j.jfr.2025049


                李 娴，王 亚，曹 霄，等. 乌鳢生长性状全基因组关联分析[J]. 渔业研究，2026，48（1） ：14 − 23.
                Li X，Wang Y，Cao X，et al. Genome-wide association study of growth traits in Channa argus[J]. Journal of Fisheries Research，2026，48（1） ：14 − 23.
                                 乌鳢生长性状全基因组关联分析




                          李    娴 ，王    亚 ，曹    霄 ，朱树人 ，安    丽 ，朱永安 ，
                                                                     1
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                                            孟庆磊 ，董    文 ，董    俊             1
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                                         （1.   山东省淡水渔业研究院，山东 济南 250013；
                                         2.   微山县渔业发展服务中心，山东 济宁 277699）
                  摘要：【目的】乌鳢（Channa argus）是中国重要的淡水经济鱼类，近年来受环境和养殖方
                  式等影响，其种质资源逐渐退化。本文利用全基因组关联分析（GWAS）方法研究乌鳢生长
                  性状的遗传基础，以期为其种质资源保护和良种选育提供依据。【方法】利用                                            Illumina
                  Nova（PE150）平台和        Super-GBS  技术对   405  尾乌鳢进行简化基因组测序；利用                  EMMAX
                  软件的高效混合模型进行              GWAS   分析，寻找与乌鳢生长性状显著关联的单核苷酸多态性
                  （SNP）位点；扫描显著性位点上下游                   50 kb  的序列，查找潜在候选基因，根据                NCBI 数据
                  库和文献检索结果，注释候选基因的生物学功能，筛选与目标性状相关的候选功能基因。
                  【结果】测序数据过滤后，共获得                   47 536  个  SNP  位点，GWAS   分析筛选到       3  个与体质量
                  性状显著关联的         SNP  位点，即    2831060、2830864、2830886。扫描显著性位点上下游                 50 kb
                  序列，注释到        7  个与体质量相关联的候选功能基因；此外，还筛选到                        6  个全长性状潜在关联
                  的  SNP  位点，注释到       17  个与全长性状相关联的潜在候选功能基因。在这些功能基因中，
                  有  7  个基因与全长和体质量性状均存在关联，分别是                         irak3、tuba1a、hspa14、prl、rint1、
                  helb  和  net1，其主要参与乌鳢的生长代谢、发育调控、细胞增殖和免疫调控等生物学过程。
                  【结论】本研究挖掘的            SNP  及功能基因与乌鳢的体质量和全长性状存在显著关联，可为乌
                  鳢生长性状的机制解析、良种选育和资源保护提供重要参考。
                  关键词：乌鳢；全基因组关联分析（GWAS） ；生长性状；Super-GBS
                  中图分类号：S917.4      文献标识码：A      文章编号：2096 − 9848 （2026） 01 − 0014 − 10

                  全基因组关联分析（Genome-wide association             鰤（Larimichthys crocea）中找到    17  个体质量性状
              study，GWAS）是针对随机群体设计的关联分析                        和  12 个全长性状相关的       SNP  位点和候选基因；方
              方法，最初被用于人类疾病相关基因位点的分析，                           家璐等   [4]  通过  GWAS  定位到与黄河鲤（Cyprinus
              如今已被广泛应用于育种研究，成为推动水产养殖                           carpio）体质量性状相关的         5  个  SNP  和候选基因。
                                          [1]
              业可持续发展的重要技术手段 。何骞等                    [2]  使用    通过  GWAS   筛选出与优良生长性状相关的分子标
              GWAS   方法在大黄鱼（Larimichthys crocea）5       条      记，可以在早期快速筛选出具有优良性状的个体，
              染色体上定位到        6  个与肌纤维性状显著相关的单                  加速育种进程，为水产动物经济性状的全基因组选
              核 苷 酸 多 态 性 （ Single  nucleotide  polymorphism，  择和品种培育提供重要依据。
              SNP）位点；崔爱君等          [3]  利用  GWAS  方法在黄条            乌鳢（Channa argus）属鲈形目（Perciformes） 、


                   收稿日期：2025-04-18    修回日期：2025-05-14
                   基金项目：山东省重点研发计划（2021LZGC029） ；国家淡水水产种质资源库（FGRC：18537）
                   第一作者：李 娴，女，副研究员，研究方向为水产种质资源保护与育种。E-mail: lxlala@sina.com
              ©《渔业研究》编辑部。本文为使用        CC BY-NC-ND 4.0 许可协议的开放获取作品。
              © Editorial Office of Journal of Fisheries Research. This is an open access article under the CC BY-NC-ND 4.0 license.
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