Page 20 - 《渔业研究》2026年第1期
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第 1 期                       李    娴等: 乌鳢生长性状全基因组关联分析                                     17

                       −4
              小于   1×10 的   SNP  位点,对这      6  个位点上下游          其进行功能注释,共注释到             17  个与乌鳢体全长性
              50 kb  区域进行扫描,寻找潜在候选关联基因并对                       状相关的潜在功能基因(表            3) 。

                           8

                           6
                         负对数P值 −log 10 (P)  4






                           2


                           0
                                  1   2  3  4  5  6  7  8  9  10  11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21222324
                                                        染色体 Chromosomes

                                                  图 3    乌鳢全长性状曼哈顿图
                                        Fig. 3    Manhatton plot of total length trait of C. argus

                  注:红线是对    GWAS  给出的  P  值划定的显著性水平线(已经进行−log 1 转换) ,红线经           Bonferroni 矫正后的  P=0.05。
                                                                      0
                  Notes: The red line represents the significance level line for the P values given by GWAS (which have already been transformed
              by −log 10 ). The red line indicates the P value of 0.05 after Bonferroni correction.


                           8

                           6
                         负对数P值 −log 10 (P)  4






                           2


                           0
                                  1   2  3  4  5  6  7  8  9  10  11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21222324
                                                        染色体 Chromosomes
                                                 图 4    乌鳢体质量性状曼哈顿图
                                         Fig. 4    Manhatton plot of body mass trait of C. argus

                  注:红线和蓝线是对       GWAS  给出的  P  值划定  2  条显著性水平线(已经进行−log 1 转换) ,蓝线是          FDR=0.05,红线是
                                                                               0
              Bonferroni 矫正后的  P=0.05。
                  Notes: The red and blue lines represent two significance level lines for the P values given by GWAS (which have already been
              transformed by −log 10 ). The blue line corresponds to a false discovery rate (FDR) of 0.05, while the red line indicates the P value of
              0.05 after Bonferroni correction.

                                         表 2    乌鳢体质量性状    GWAS  分析结果及候选基因
                             Tab. 2    GWAS analysis results and candidate genes for body mass trait of C. argus
                  染色体        SNP  位置      P  值        基因  ID        候选基因                 编码蛋白
                Chromosome  SNP locations  P value    Gene ID     Candidate genes       Coding proteins
                                                  EXN66_Car020554    irak3      Interleukin-1 receptor-associated kinase 3
                                                  EXN66_Car020555
                   21         2831060    2.30E-06  EXN66_Car020556
                                                  EXN66_Car020557    tuba1a          Tubulin alpha-1A chain
                                                  EXN66_Car020558
                                                  EXN66_Car020559
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