Page 8 - 《水产学报》2025年第5期
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马宝珊，等                                                                 水产学报, 2025, 49(5): 059301

              两套染色体间存在大量的重复序列插入，使得                             源的保护和开发利用提供基础信息。近年来，
              附近基因的表达模式发生改变，产生了再二倍                             利用线粒体序列、SSR          和  SNP  等多种分子标记，
              化的特征，基因组中与            DNA  修复、叶酸转运代              学者们对不同地区的裂腹鱼类种群开展了遗传
              谢等相关基因受到强烈正选择，可能与其高原                             评价，揭示其群体遗传结构、遗传多样性状态
              环境适应密切相关。Tian           等 [40]  通过三代  PacBio、    或进化关系，为了解裂腹鱼类的种质遗传现状
              二代   Illumina 和  Hi-C  测序相结合的方法，获得               提供有价值的信息。杨天燕等               [50]  利用  SSR  标记
              大小为     2.03 Gb、scaffold N50  为  44.93 Mb、包      对塔什库尔干、多浪渠首等               5  个塔里木裂腹鱼
              含  46  条染色体的青海湖裸鲤基因组，并注释                         地理种群的遗传多样性进行了比较分析，发现
              了  56 397  个基因，加倍基因主要与            DNA  修复、       群体间遗传分化明显，并以塔什库尔干群体的
              转运等高原极端环境适应相关。目前花斑裸                              遗传多样性最高。李光华等               [51]  利用开发的  SNP
                 [41]
              鲤 、尖裸鲤  、扁吻鱼            [43]  等裂腹鱼类基因组           标记对金沙江短须裂腹鱼进行遗传多样性分析，
                           [42]
              也已经获得破译，这些基因组信息为裂腹鱼类                             结果显示，遗传多样性指数和多态性信息含量
              的进化、极端环境适应性、基因组多倍化以及                             分别为    0.338 6  和  0.256 2，具有中等水平的遗传
              基因功能等研究提供了宝贵的遗传资源。                               多样性，并认为这与人为干扰有关。此外，相

                   分子标记  筛选和开发分子标记对后期                          似的研究在齐口裂腹鱼 、四川裂腹鱼 、青
                                                                                     [52]
                                                                                                    [53]
              裂腹鱼类遗传性状解析以及分子选育具有重要                             海湖裸鲤    [54]  和异齿裂腹鱼    [55]  等其他裂腹鱼类中
              意义。有关齐口裂腹鱼的研究较多，Luo                     等 [44]   也广泛开展，相关遗传信息为裂腹鱼类的资源
              首次通过     Illumina 二代测序鉴定了        857 535  个假     保护和管理提供了参考依据。

              定的单核苷酸多态性           (SNP) 标记，其中      33  个落
                                                               3.3    性状遗传解析
              在免疫相关基因上，有            20  个表现出显著的多态
              性。Luo    等 [45]  从脾脏转录组中分离检测到7 545                   近年来，越来越多的研究开始利用比较转
              个假定的简单重复序列             (微卫星序列，SSR) 和             录组分析等方法，对裂腹鱼类的高原适应机制
              857 535  个  SNP  标记，并鉴定了        500  多个免疫        以及驯养、生长和抗病等性状进行遗传解析，
              相关基因。Zhou       等 [46]  在养殖群体中分离和鉴定              并挖掘到了一些关键的调控基因和通路，为深
              出  33  个  SNP  标记，观测杂合度和期望杂合度                    入了解裂腹鱼类的适应性机制提供了新见解，
              分别为    0.031 2~0.843 8  和  0.031 2~0.507 9，其中    也为裂腹鱼类种质遗传资源开发和利用提供了
              有  5  个 位 点 与  Hardy-Weinberg  平 衡  (HWE) 存      基础资料。

              在 显 著 偏 差 。 杨 月 静 等      [38]  报 道 有  2  个  SNPs     高原适应  与裂腹鱼类高原适应机制相
              (ug25050-1 678  和  ug22712-0-2 452) 与生长性状        关的基因很多，主要参与其形态发育、能量代
              显著相关，可作为选育的候选分子标记。应用                             谢、蛋白质代谢和免疫调节等，相关基因可能
                                                                                               [1]
              同样的方法，Ma 等         [47]  鉴定了  63  个位于拉萨裂         与低温、强辐射和盐碱适应等有关 。Yu                    等  [56]
              腹鱼免疫相关基因上的             SNP  位点，并发现其中             指出高海拔和亚高海拔的裂腹鱼类在青藏高原
              36  个具有显著多态性，观测杂合度和期望杂合                          隆起过程中面临不同的选择压力，与蛋白质泛
              度分别为     0.078 9~0.957 7  和  0.076 3~0.503 3。此   素化调节、感官器官形态发生、血液循环和血
              外，在裂腹鱼类物种鉴定 、齐口裂腹鱼细菌                             管发育等相关的基因在两类鱼体内的表达模式
                                       [48]
              性败血症     [49]  等方面也开展了分子标记开发应用                   产生了差异。

              的相关研究，获得的标记不仅为裂腹鱼类的物                                 驯养与生长  Zhou          等   [57]  对人工驯养过
              种保护提供了可靠的技术方法，也为裂腹鱼类                             程中异齿裂腹鱼的转录组和代谢组分析发现，
                                                               与野生群体相比，驯养群体卵巢中与卵母细胞
              遗传连锁图谱构建和经济性状的提升提供了基
              础资料。                                             生长和死亡途径相关的基因显著差异表达，肝

                                                               脏中不饱和脂肪酸的生物合成、淀粉和蔗糖代
              3.2    种质遗传评价
                                                               谢以及脂肪酸的合成这            3  种常见的途径也显著
                   种质遗传多样性和遗传结构是评价种群生                          富集，因而提示在异齿裂腹鱼的人工繁殖过程
              存适应和发展进化的前提，能够为物种遗传资                             中应特别注意脂肪酸的组成和摄入量。Li 等                     [58]

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
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