Page 151 - 《水产学报》2026年第04期

4 期 水 产 学 报 50 卷

鱼类是世界上最为丰富的脊椎动物类群，是 独房间内，每次过滤前将所用的镊子、离心管、
生物多样性的重要组成部分。保护鱼类多样性是 装置等均提前置于质量分数为 10% 的次氯酸钠溶
[1]
渔业管理及资源可持续利用的关键措施之一 。 液中 (浸泡 10 min)，并使用灭菌水冲洗干净。根
目前鱼类多样性调查方法可大致分为传统调查方 据水深设置不同的 eDNA 采样水层：水深在 10 m
法和环境 DNA (eDNA) 技术两大类 [2-3] 。传统调查 以内的站位，只设置表层采水层；水深在 10~20 m
方法主要依赖于现场调查和形态鉴定，如以拖网、 的站位，则设置表层和底层 2 个采水层；水深大
围网等为工具进行渔获物采集和后续鉴定。此类 于 20 m 的站位，则设置表层、中层和底层 3 个采
调查方法普遍存在缺点：①调查费用高、所需时 水层。分别在每个采水层取 2 个平行样，每个平
间久；②靶生物捕获率低；③物种鉴定困难；④ 行样先静置 15 min (沉淀大颗粒杂质)，之后参考
对调查对象及其所在生境破坏性大等 [2-3] 。针对以上缺 Djurhuus 等 [11] 的研究使用硝酸纤维滤膜过滤水样。

点，eDNA 技术为鱼类多样性监测提供了新的研 所用滤膜直径为 47 mm、孔径为 0.45 µm，每个平
[4]
究思路和调查手段，在外来鱼类监控 、本土濒危 行样的累计过滤体积为 2 L (1 L/滤膜×2 滤膜)，并
鱼类保护 、生物量评估 等方面发挥了重要作用。 且使用纯净水在每“站位·水层”各设置 1 个相同过
[5]
[6]
浙江省位于亚热带季风气候带，温暖湿润， 滤体积的 eDNA 阴性对照。过滤后的滤膜用酒精
浸润保存放置于独立冰箱内 (不含任何渔获物)，上
是我国重要的海洋大省。受多种水团季节性分布
岸后送至青岛华大基因研究院进行 eDNA 提取 (同
的影响，浙江近岸海域水文环境独特、浮游动植
一个平行样内的 2 张滤膜共同提取为 1 个 eDNA
物饵料丰富，是众多经济鱼类、甲壳类等产卵繁
样品，从而增加 eDNA 的总获得量) 及高通量测序
殖和索饵育肥的理想场所 [7-8] 。然而，随着捕捞压
(NGS)。建库类型为全基因组测序 (WGS)，测序平
力的加大及生态环境的破坏，浙江主要渔场 (舟山
台为 BGISEQ-500RS，所用引物为 MiFish-U (正向
渔场、温台渔场等) 渔获物小型化 、低龄化 [10] 现
[9]
引物序列 F：5'-GTCGGTAAAACTCGTGCCAGC-
象日趋严重。使用传统调查方法进行本海域物种
3'；反向引物序列 R：5'-CATAGTGGGGTATCTAA
养护效果评估可能会加剧渔业资源破坏。国内外
TCCCAGTTTG-3')(扩增片段位于线粒体 12S rRNA
一些研究认为，应该优先使用环境友好型的 eDNA
[12]
基因上) 。eDNA 采样结束后，进行拖网作业。
技术进行鱼类多样性调查。然而，eDNA 技术在
拖网调查船为单船底拖网渔船，船长 38 m，总吨
实际应用过程中也存在样品易污染、参考数据库
位 150 t，主机功率 202 kW。调查网具网口拉紧周
不全面、假阴性/假阳性等问题 [2-3] 。该技术是否已
长 50 m，网身拉紧长度 48 m，囊网最小网目尺
经发展到了可以全面取代传统调查方法的程度尚
寸 25 mm，上纲长 30 m，下纲长 38 m。各站位拖
存疑问。为比较 eDNA 宏条形码与拖网调查在分
网时间为 0.5 h，平均拖速 3 kn。对于拖网渔获，
析鱼类多样性方面的一致性与差异性，评估 eDNA
由专门的调查人员分装处理，eDNA 采样人员不
技术能否取代拖网进行调查，本研究以浙江南部
进行任何接触。
海域为例，分析了两种调查方法的鱼类组成、物
1.2 数据分析
种优势度、群落多样性指数等。相关研究结果对
认识 eDNA 技术的优缺点、评估 eDNA 技术对传 通过质量初筛的原始序列按照 index 和 Bar-
统调查方法的替代程度及合理使用不同调查方法
N
提供了依据。
B27 B28 B29 B30
浙江省 B31 B32 B33 B34 B35
1 材料与方法 28.0° Zhejiang Province B36 B37 B38
B39 B40 B41 B42 B43
B44 B45 东海
1.1 样品采集 27.5° B46 B47 B48 B49 C01 East China Sea
B51
福建省 B50 B52 B53 C02
B54
采 样 时 间 为 2018 年 春 季 (4 月 9 日 — 4 月 27.0° Fujian Province B55 B56 B57 B58 C03
22 日)，共设置了 35 个采样站位 (图 1)。为了避免 120.0° 120.5° 121.0° 121.5° 122.0°122.5°123.0° E ¢
污染，每个站位的 eDNA 采样先于拖网采样，并 图 1 采样站位分布
且将 eDNA 过滤室设置于底拖网调查船 2 楼的单 Fig. 1 Distribution of sampling stations

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