Page 150 - 《水产学报》2026年第04期

文章编号: 1000-0615(2026)04-049312-16 , 2026, 50(4): 049312

JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA

DOI: 10.11964/jfc.20251115231

陈治, 蒋日进, 卢占晖, 等. 基于 eDNA 宏条形码与拖网调查的鱼类多样性结果比较——以浙江南部海域为例 [J]. 水产
学报, 2026, 50(4): 049312.
Chen Z, Jiang R J, Lu Z H, et al. A comparison of fish diversity results based on eDNA metabarcoding and trawl net: a case
study of the southern coastal waters of Zhejiang Province [J]. Journal of Fisheries of China, 2026, 50(4): 049312 (in Chinese).

基于 eDNA 宏条形码与拖网调查的鱼类多样性结果

比较——以浙江南部海域为例

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陈 治 ， 蒋日进 ， 卢占晖 ， 张亚洲 ， 刘姗姗 ， 高天翔 ， 李鹏飞 2*
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(1. 海南热带海洋学院崖州湾创新研究院，海南 三亚 572022；
2. 浙江省海洋水产研究所，浙江 舟山 316021；
3. 深圳华大生命科学研究院，广东 深圳 518083)

摘要： 【目的】为了比较 eDNA 宏条形码与拖网调查在鱼类多样性上的相似性和差异性，
评估 eDNA 技术能否取代拖网进行调查。 【方法】以浙江南部海域为例，采用生物信息学、
传统形态鉴定、非度量多维尺度分析、差异显著性检验及线性回归分析等，比较了两种调
查方法的鱼类组成、物种优势度、群落多样性指数等。 【结果】①高通量测序结果中出现
了不少 (19.92%) 非本海域鱼类 OTUs (淡水鱼类、深海鱼类、热带珊瑚礁鱼类等)；采样水
层 (表层、中层、底层) 虽然不影响 eDNA 检出的鱼类 OTUs 个数 (P≥0.073)，但会影响鱼
类 OTUs 组成 (stress=0.138，R=0.117，P=0.001)；提高采样密度 (平行样个数、采样水层
−3
数) 能够极显著地增加鱼类 OTUs 个数 (P≤1.1×10 )；本海域有相当比例 (24.402%) 的鱼类
OTUs 处于低可注释状态，且部分鱼类序列存在种间相同或种内变异；② eDNA 检出的鱼
类物种数远高于拖网 (152 种 vs. 75 种)，二者存在显著的线性相关性 (P=0.049 7，r Pearson =
0.381，R =0.153)；③以全部鱼类为分析对象时两种调查方法在物种优势度上达到显著性差
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异 (P=0.034)；鳀、黄姑鱼等众多共有鱼类、优势种/极优势种在两种调查方法间的物种优
势度差 1~2 个数量级；④ 12 种高频率出现鱼类中，仅龙头鱼和中华栉孔虾虎鱼的序列丰
度与尾数/重量间有线性相关性，其余物种拟合模型中的 r Pearso n 较低甚至为负值；⑤两种
调查方法测得的群落多样性指数差异较大，其线性相关性同样很低 (P≥0.087)。 【结论】
① eDNA 存在较大的不确定性；②除个别指标、物种或站位外，很难基于其中一种调查方
法的结果去建模预估另一种调查方法的对应数值；③两种调查方法并不能相互取代，二者
为互补、互校关系。本研究为认识 eDNA 技术的优缺点及合理使用不同调查方法提供了依据。
关键词: 鱼类多样性；eDNA；宏条形码；拖网；浙江南部海域
中图分类号: S 932.4 文献标志码: A

收稿日期：2025-11-29 修回日期：2026-02-07
资助项目：国家重点研发计划 (2024YFD2400401)
第一作者：陈治，从事海洋鱼类多样性研究，E-mail：change@139.com
通信作者：李鹏飞，从事渔业生态学研究，E-mail：pengfei5116@163.com
©《水产学报》编辑部（CC BY-NC-ND 4.0） Copyright © Editorial Office of Journal of Fisheries of China (CC BY-NC-ND 4.0)
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