Page 79 - 《水产学报》2025年第11期
P. 79

杨磊,等                                                                 水产学报, 2025, 49(11): 119607


                                                                       GL
                                                                          GF
                                                                            IG
                                      GL
                                                                          LF

                                      GF
                                    IG

                              50 μm  LF                   1  50 μm                        2



                                                                          GF

                                                                              GL
                                                                         IG
                                          GF
                                                                                CL
                                     IG
                                       GL




                              50 μm                       3  50 μm                        4

                                 图版 Ⅱ    碱胁迫处理    3、6、9 h  以及对照组 (0 h) 金钱鱼鳃组织结构图
              GL. 鳃小片,IG. 鳃小片间距,CL. 鳃小片卷曲,LF. 鳃小片融合 (黑色箭头),GF. 鳃丝。
                     Plate Ⅱ Gill tissue structure of S. argus treated with alkali stress for 3, 6, 9 h and control group (0 h)
              GL. gill lamellae, IG. the intervals of secondary gill lamella, CL. curling of secondary lamellae, LF. lamellar fusion (the black arrow), GF. gill filament.

                                         表 2    金钱鱼肝脏、鳃组织转录组测序数据统计
                                Tab. 2    Summary statistics of livers and gills sequencing data in S. argus
                                                                    测序质量值>20的      测序质量值>30的
                    样本         原始读数     原始碱基      净读数      净碱基数                                   GC含量/%
                    sample     raw read  raw base  clean read  clean base  碱基比例/%    碱基比例/%         GC pct
                                                                         Q20            Q30
                A1gi 对照组鳃1     41 758 548  6.26G  40 470 200  6.07G      97.18          92.66       44.88
                A2gi 对照组鳃2     42 985 076  6.45G  41 658 892  6.25G      96.83          91.87       44.85
                A3gi对照组鳃3      49 821 778  7.47G  49 767 678  7.47G      96.80          91.33       41.98
                A4li 对照组肝4     51 507 832  7.73G  51 438 986  7.72G      96.81          91.48       42.76
                A5li 对照组肝5     41 651 520  6.25G  39 546 846  5.93G      97.24          92.76       46.93
                A6li 对照组肝6     45 414 230  6.81G  43 292 762  6.49G      97.36          92.89       46.77
                B1gi 碱胁迫组鳃1    45 348 642  6.8G  45 252 904  6.79G       96.61          91.09       43.29
                B2gi 碱胁迫组鳃2    43 418 960  6.51G  41 537 668  6.23G      96.90          92.02       44.86
                B3gi 碱胁迫组鳃3    43 642 398  6.55G  41 775 430  6.27G      97.05          92.37       45.07
                B4li 碱胁迫组肝4    43 751 024  6.56G  41 203 806  6.18G      97.09          92.39       44.39
                B5li 碱胁迫组肝5    41 990 792  6.3G  38 302 894  5.75G       96.66          91.09       43.70
                B6li 碱胁迫组肝6    43 098 602  6.46G  41 784 840  6.27G      97.21          92.62       46.39

              (表  3)。上述结果表明数据可靠,测序质量良好,                         2.4    碱胁迫下基因表达差异分析

              适合进行后续分析。                                            通过差异表达基因 (DEGs) 分析,实验比

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
                                                            5
   74   75   76   77   78   79   80   81   82   83   84