Page 7 - 《水产学报》2026年第2期
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2 期 水 产 学 报 50 卷
江流域野生鲮群体的期望杂合度 (H ) 为 0.688 1~ 黄群体,同时保留一定比例的深青群体以维持整
e
0.777 2,观测杂合度 (H ) 为 0.510 5~0.765 6。相 体种群的遗传多样性。此外,对来自湄公河、红
o
比较,鲮养殖群体的遗传多样性水平明显偏低 , 河和珠江流域共 12 个地理地点的鲮群体进行遗传
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这可能是由于养殖群体经历了奠基者效应 、遗 结构分析发现,不同水系间的群体结构存在显著
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传漂变 以及人工选择等因素,导致遗传多样性 差异。由于地理隔离,湄公河流域的鲮与红河、
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的丢失。此外,微卫星分析表明,鲮群体的遗传 珠江流域的鲮存在显著遗传分化 (表 1)。不同地
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分化主要存在于野生群体和养殖群体之间 。 理群体之间的遗传分化,可能与各自所处的环境
鲮不同群体之间已产生明显的遗传结构差异。 差异以及群体间基因交流受阻等因素有关 。因
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基于扩增片段长度多态性 (AFLP) 标记 [62] 和线粒 此,在鲮新品系选育过程中,不仅要考虑不同体
体 D-loop 序列 [63] 分析发现,广东鲮浅黄群体和深 色群体间的差异,还应注意保留不同地理来源的
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青群体已经出现显著的遗传分化 ,浅黄群体不 种质资源。通过建立不同水系来源的鲮种质资源
仅拥有更高的遗传多样性,在早期生长阶段也表 库,可有效保护和利用这些独特的遗传资源;同
现出生长优势。在种质资源收集和选育过程中, 时考虑选取不同水系的群体作为亲本,利用它们
应优先考虑遗传多样性较高且早期生长较快的浅 的遗传差异培育优良品系。
表 1 鲮不同群体遗传多样性相关数据
Tab. 1 Data related to genetic diversity of different populations of C. molitorella
微卫星数量/对 平均观测 平均期望 多态性信
群体来源 群体类型 样本数量/尾 等位基因数 文献
no. of SSR 杂合度 杂合度 息含量
group origin population type no. N a references
loci H o H e PIC
西江流域、广东番禺 野生、养殖 40 8 2~7 0.61±0.20 0.80±0.09 0.72±0.10 [58]
西江流域 野生 115 11 4~23 0.510 5~0.627 3 0.712 0~0.765 6 0.749 8 [61]
西江流域 野生 59 7 2~16 0.777 2±0.193 1 0.688 1±0.181 9 N/A [63]
西江流域 野生 64 12 3~7 0.619 8 0.632 2 0.574 [65]
珠江水系 养殖 20 12 2~20 0.641 7 0.638 5 N/A [66]
西江流域 野生 62 15 1~10 0.543 0 0.606 8 0.593 3 [67]
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3.5 基因组学研究 评估的基因组完整度达 97.4% 。高质量的鲮和
斯塔野鲮基因组序列的构建,有望使研究者从基
基因组学数据为鲮的遗传特征分析、性别决
因组层面更全面地认识这些物种的遗传特征,例
定机制挖掘以及物种间比较提供了重要基础 [69] 。
如基因组结构与功能、重复序列的组成与分布、
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2015 年,Zhang 等 首次公布了鲮线粒体基因组
适应性进化的关键基因位点等,也为功能基因定
序列信息,长度 16 602 bp,包括 13 个蛋白质编码
位及精准育种提供了基础平台 。
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基因、22 个 tRNA 基因、2 个 rRNA 基因和2 个非
编码区,碱基组成为 A 占 32.32%、G 占15.26%、T 4 鲮种质遗传改良研究
占 25.00%、C 占 27.41%,A+T 含量较高 (57.32%)。
2023 年,研究者成功组装出雄性鲮的基因组草图, 鲮、麦瑞加拉鲮和斯塔野鲮同属斯塔野鲮亚
获 得 1 150 494 个 scaffold, 估 算 基 因 组 大 小 为 科,是我国南方地区的重要养殖鱼类。鲮肉质鲜
1 078.7 Mb,GC 含量为 35.5%。通过 2b-RAD 测 美、营养丰富,但生长速率较麦瑞加拉鲮和斯塔
序技术鉴定出 12 个雄性特异性 scaffold,并据此 野鲮慢,耐低温能力也相对较弱,因此鲮养殖产
获得 5 个性别鉴定分子标记,证实鲮属于 XY 型 业发展受到制约。培育生长速率快且耐低温的鲮
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性别决定 。同年,还组装完成了斯塔野鲮的染 新品系,不仅能提高传统养殖区域养殖户的积极
色体级基因组草图,得到 25 条染色体和 2 844 个 性,也可扩大鲮的养殖范围,将其推广至北方生
未定位的 scaffold,基因组大小约 946 Mb 。2025 长季较短的区域。
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年,鲮染色体级基因组组装成果发布,组装总长度 近年来,与生长速率等经济性状相关的分子
达到约 1.05 Gb,scaffold N50 为 39.38 Mb,BUSCO 标记不断被挖掘。基于这些分子标记技术,如标
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