Page 135 - 《水产学报》2025年第12期
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俞韩绣,等                                                                水产学报, 2025, 49(12): 129611

              所有指标的测定均按照南京建成生物工程研究                             reagent Kit with gDNA Eraser) 说明书进行反转录,
              所生产的试剂盒说明书操作。                                    得到   cDNA  并于−20 ℃    保存。利用       NCBI 数据
                                                               库查找目的基因序列并设计特异性引物                     (表  1),
               1.5    肝胰腺抗氧化及免疫相关基因表达量测定
                                                               引物由生工生物工程          (上海) 股份有限公司合成。
                   使用   TRIzol 法提取肝胰腺组织的总            RNA,      以  β  肌动蛋白   (β-actin) 作为内参基因,采用实
              通过琼脂糖凝胶电泳检测             RNA  的完整性,并用             时荧光定量      PCR  方法测定各组相关基因的表达

              微量紫外分光光度计检测              RNA  的浓度和纯度。            量,每个样品进行         3  次重复,通过      2 −∆∆C t 方法进
              按 照   TaKaRa 逆 转 录 试 剂 盒    (PrimeScript  RT     行计算。
                                                     TM

                                               表 1    荧光定量  PCR  扩增引物序列
                               Tab. 1    Real-time fluorescence quantitative PCR amplified primer sequence
                      引物名称                     上游引物序列(5′-3′)                       下游引物序列(5′-3′)
                       primer                    forward primer                      reverse primer
                      Prx                 TGTGGATGGCCAGTTCAAGG                 CTCGACACGGTCAGAGAAGG
                      Nrf2                ATCTTGTTGGTCCCTCGCTC                 AGTATGGCAGGGTTGGTTGG
                      p53                 AGACGCCCATTCTGCATTGT                 GGCGTCCTGCTTTTCTCATC
                      MyD88               AGGTGCACCAGAGTCATTGT                 CTACGCTGAGAGCATGAGCA
                      LZM                 CGCGACACCGAACGCTAC                   CGAGTTGGAACCACGAGACC
                      HSP70               GGTGTGCAACCCCATCATTAC                TCCTCGATGGTGGGTCCG
                      β-actin             GCGACATTGACATCAGGAAGG                GCACTTGCGGTGAACGATAC
              注:Prx. 过氧化物还原酶,Nrf2. 核因子E2相关因子2,p53. 肿瘤抑制基因p53,MyD88. 髓样分化因子88,LZM. 溶菌酶,HSP70. 热休克蛋白70。
              Notes: Prx. peroxiredoxin, Nrf2. nuclear factor erythroid 2-related factor 2, p53. tumor suppressor gene p53, MyD88. myeloid differentiation primary
              response protein 88, LZM. lysozyme, HSP70. heat shock protein 70.

               1.6    肠道细菌高通量测序                                 1.8    数据分析
                   将斑节对虾肠道样品送至北京百迈客生物                              所 有 实 验 结 果 以 平 均 值 ±标 准 差       (mean±
              科技有限公司进行           16S rRNA  高通量测序。首             SD) 表示,采用      SPSS 22.0  软件进行单因素方差
              先提取肠道菌群的总            DNA,并根据       16S rRNA      分析   (One-Way ANOVA),用      Duncan  氏多重检
              的保守区域       (V3~V4  区) 设计特异性引物,在引                验法进行多重比较分析组间差异显著性,P<
              物末端添加测序接头,随后进行                 PCR  扩增并对         0.05  说明差异显著。
              其产物进行纯化、定量和均一化,构建测序文
              库。使用      Illumina NovaSeq 6000  进行测序,获           2    结果
              取原始图像数据文件,将其通过碱基识别后分
              析转化为原始测序序列             (Raw Reads)。经质量过           2.1    不同养殖密度下斑节对虾生长性能
              滤和去噪处理,得到有效数据,最终使用百迈
                                                                   在不同密度养殖          42 d  后,斑节对虾的       SR
              客云平台     (www.biocloud.net) 进行数据分析。
                                                               随养殖密度增加显著下降,且各组差异显著
               1.7    肠道组织学切片的制作与观察                            (P<0.05)。WGR、SGR、CF       均表现出先升后降

                   将经   Bouin  氏液固定后的肠道组织取出,                   的 趋 势 。 其 中 , WGR     和  SGR  表 现 为   D375>
              进行梯度酒精脱水处理,随后进行包埋和切片。                            D450>D300>D525>D225>D600,且      D300、D375
              脱蜡后,使用苏木精-伊红               (H.E) 染色法染色,          和  D450  显著高于其他组        (P<0.05);CF  表现为
              最后于光学显微镜下观察肠道黏膜的组织学形                             D450>D375>D300=D525>D225>D600。 FCR        则
              态并拍照保存。在每个组织切片上随机选取                        6     是先降后升,表现为           D225>D600>D525>D450>
              根平直、伸展良好的肠绒毛,使用                  Image J 软件      D300>D375,且    D375  显著低于其他组        (P<0.05)
              测量肠绒毛的高度和宽度,及肠道的肌层厚度。                            (表  2)。

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
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