Page 186 - 《水产学报》2025年第11期
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王孟,等 水产学报, 2025, 49(11): 119315
东鲑同域分布的水域中土著鱼类种群丰度明显 V4 区有着不同的分类学覆盖范围,但本研究
减少。摄食生态的可塑性与适应性可能是导致 中 COI 基于 BOLD 数据库对 ASVs 进行注释的
亚东鲑在该河段成为绝对食物链主导者的重要 分辨率更高,如果研究的目的是将主要食物类
原因,其他鱼类则在猎物资源竞争和捕食作用 群鉴定到种、属或科水平,COI 要比 18S rRNA
中逐渐失去了生存的机会,因此,在保护亚东 更加合适。然而,就整体而言,基于多基因组
鲑野生种群的同时不能忽视对亚东河水生态系 合分析,有助于获得较全面的食物组成,增加
统造成的负面影响。 了猎物被检测的概率。
3.2 DNA 条形码技术在亚东鲑食物组成研究中 4 结论
的适用性
DNA 宏条形码技术具有灵敏性高、研究对 亚东鲑是西藏自治区重要的经济养殖品种,
象广、取样类型不受限制等优于其他动物食性 被列入西藏自治区二级重点保护野生动物,近
分析方法,已经被广泛用于各种动物的食性分 年来野生亚东鲑种群资源正在迅速下降。本实
析 [44-46] 。本研究使用 18S rRNA V4 和 COI 基因 验基于 DNA 宏条形码技术,利用 18S rRNA 和
高变区分析亚东鲑的食物组成,尽管 2 种分子 COI 基因首次对亚东河野生亚东鲑食物组成进
数据均将双翅目确定为亚东鲑的绝对优势食物, 行了分析,确定了亚东鲑主要食物类群为双翅
但其他食物类群的重要性以及检测到的食物类 目、鳞翅目和鞘翅目等昆虫,次要食物有底栖
群丰度并不完全一致。18S rRNA V4 区得到的 无脊椎动物如带丝蚓目以及少量的浮游动物和
食物类群的 ASVs 数量 (196 个) 显著高于扩增 浮游植物。本实验基于多基因组合分析方法检
COI 高变区得到的 ASVs 数量 (76 个);被共同 测到了较单一分析方法更广泛的食物类群多样
检测到的 10 个食物类群中蜉蝣目、带丝蚓目在 性。该结果对深入了解亚东鲑摄食生态提供了
两种分子标记中得到的结果相对丰度存在显著 参考,证明了 DNA 宏条形码在评估亚东鲑食物
性差异。同时,18S rRNA V4 区获得的 ASVs 注 组成的价值。
释完整性较低,虽然所有 ASVs 均注释到纲,
但仅 17.86% 的 ASVs 可以注释到种的级别,注 参考文献 (References):
释到 6 个物种;COI 有 36.84% 的 ASVs 可以注 [ 1 ] 王万良, 牟振波, 曾本和, 等. 亚东鲑的研究现状及展望 [J].
释到种的级别,注释到 24 个物种。18S rRNA 西藏农业科技, 2019, 41(S1): 197-200.
V4 区注释采用 Silva 138.1 数据库,在筛选过程 Wang W L, Mou Z B, Zeng B H, et al. Research status and pro-
中发现 18S rRNA 注释到更多的寄生生物,如扁 spects of Salmon trutta[J]. Xizang Journal of Agricultural Sci-
形动物门 (Platyhelminthes)、线形动物门和纤毛 ences, 2019, 41(S1): 197-200 (in Chinese).
虫门,以及维管植物;COI 注释采用了 BOLD [ 2 ] 王芳. 亚东鲑若干养殖生物学特性研究 [D]. 上海: 上海海洋
数据库,注释到更多脊椎动物如人 (Homo sapi- 大学, 2015.
ens)、鸟和家猪 (Sus scrofa)。这种基于多基因标 Wang F. Studies on several culture biology characteristics of
记分析得到的结果并不完全一致的情况在其他 Salmo trutta[D]. Shanghai: Shanghai Ocean University, 2015
[19]
研究中均有存在,例如,Campell 等 基于 18S (in Chinese).
rRNA 和 COI 基因对北梭鱼 (Albula vulpes) 的食 [ 3 ] 户国, 王芳, 周建设, 等. 野生亚东鲑群体遗传多样性及其种
性分析显示,18S rRNA 获得的可操作分类单元 质来源研究 [J]. 东北农业大学学报, 2016, 47(1): 58-65.
(OTUs) 注 释 到 纲 的 数 量 多 于 COI 基 因 , 18S Hu G, Wang F, Zhou J S, et al. Study on genetic diversity and
rRNA 检测到的独有食物类群显著高于 COI 基 germplasm sources of wild Yadong salmon population[J].
因 。 Coker 等 [44] 基 于 18S rRNA 和 COI 对 红 海 Journal of Northeast Agricultural University, 2016, 47(1): 58-
11 种蝴蝶鱼科 (Chaetodontidae) 鱼类的食物组成 65 (in Chinese).
分析显示,18S rRNA 获得的 ZOTUS (零半径 [ 4 ] 豪富华, 陈毅峰, 唐卫星, 等. 亚东鲑的年龄与生长的研究 [J].
OTU) 数量明显高于 COI 基因,注释到物种的 水生生物学报, 2007, 31(5): 731-737.
数量也高于 COI 基因。尽管 COI与 18S rRNA Hao F H, Chen Y F, Tang W X, et al. Age and growth of Salmo
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