Page 186 - 《水产学报》2025年第11期
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王孟,等                                                                 水产学报, 2025, 49(11): 119315

              东鲑同域分布的水域中土著鱼类种群丰度明显                             V4  区有着不同的分类学覆盖范围,但本研究
              减少。摄食生态的可塑性与适应性可能是导致                             中  COI 基于  BOLD   数据库对     ASVs 进行注释的
              亚东鲑在该河段成为绝对食物链主导者的重要                             分辨率更高,如果研究的目的是将主要食物类
              原因,其他鱼类则在猎物资源竞争和捕食作用                             群鉴定到种、属或科水平,COI 要比                 18S rRNA
              中逐渐失去了生存的机会,因此,在保护亚东                             更加合适。然而,就整体而言,基于多基因组
              鲑野生种群的同时不能忽视对亚东河水生态系                             合分析,有助于获得较全面的食物组成,增加
              统造成的负面影响。                                        了猎物被检测的概率。

               3.2    DNA  条形码技术在亚东鲑食物组成研究中                     4    结论
              的适用性
                   DNA  宏条形码技术具有灵敏性高、研究对                           亚东鲑是西藏自治区重要的经济养殖品种,
              象广、取样类型不受限制等优于其他动物食性                             被列入西藏自治区二级重点保护野生动物,近
              分析方法,已经被广泛用于各种动物的食性分                             年来野生亚东鲑种群资源正在迅速下降。本实
              析  [44-46] 。本研究使用   18S rRNA V4  和  COI 基因       验基于    DNA  宏条形码技术,利用           18S rRNA  和
              高变区分析亚东鲑的食物组成,尽管                    2  种分子       COI 基因首次对亚东河野生亚东鲑食物组成进
              数据均将双翅目确定为亚东鲑的绝对优势食物,                            行了分析,确定了亚东鲑主要食物类群为双翅
              但其他食物类群的重要性以及检测到的食物类                             目、鳞翅目和鞘翅目等昆虫,次要食物有底栖
              群丰度并不完全一致。18S rRNA V4              区得到的          无脊椎动物如带丝蚓目以及少量的浮游动物和
              食物类群的       ASVs 数量    (196 个) 显著高于扩增            浮游植物。本实验基于多基因组合分析方法检
              COI 高变区得到的        ASVs 数量    (76 个);被共同          测到了较单一分析方法更广泛的食物类群多样
              检测到的     10 个食物类群中蜉蝣目、带丝蚓目在                      性。该结果对深入了解亚东鲑摄食生态提供了
              两种分子标记中得到的结果相对丰度存在显著                             参考,证明了       DNA  宏条形码在评估亚东鲑食物

              性差异。同时,18S rRNA V4          区获得的     ASVs 注      组成的价值。
              释完整性较低,虽然所有               ASVs 均注释到纲,
              但仅   17.86%  的  ASVs 可以注释到种的级别,注                 参考文献     (References):
              释到   6  个物种;COI 有      36.84%  的  ASVs 可以注      [  1  ]   王万良, 牟振波, 曾本和, 等. 亚东鲑的研究现状及展望    [J].
              释到种的级别,注释到              24  个物种。18S rRNA              西藏农业科技, 2019, 41(S1): 197-200.
              V4  区注释采用      Silva 138.1  数据库,在筛选过程                 Wang W L, Mou Z B, Zeng B H, et al. Research status and pro-
              中发现    18S rRNA  注释到更多的寄生生物,如扁                        spects of Salmon trutta[J]. Xizang Journal of Agricultural Sci-
              形动物门      (Platyhelminthes)、线形动物门和纤毛                  ences, 2019, 41(S1): 197-200 (in Chinese).
              虫门,以及维管植物;COI 注释采用了                    BOLD     [  2  ]   王芳. 亚东鲑若干养殖生物学特性研究    [D]. 上海: 上海海洋
              数据库,注释到更多脊椎动物如人                   (Homo sapi-         大学, 2015.
              ens)、鸟和家猪      (Sus scrofa)。这种基于多基因标                  Wang  F.  Studies  on  several  culture  biology  characteristics  of
              记分析得到的结果并不完全一致的情况在其他                                  Salmo  trutta[D].  Shanghai:  Shanghai  Ocean  University,  2015
                                                [19]
              研究中均有存在,例如,Campell 等 基于                  18S          (in Chinese).
              rRNA  和  COI 基因对北梭鱼       (Albula vulpes) 的食    [  3  ]   户国, 王芳, 周建设, 等. 野生亚东鲑群体遗传多样性及其种
              性分析显示,18S rRNA         获得的可操作分类单元                     质来源研究   [J]. 东北农业大学学报, 2016, 47(1): 58-65.
              (OTUs) 注 释 到 纲 的 数 量 多 于      COI 基 因 , 18S           Hu G, Wang F, Zhou J S, et al. Study on genetic diversity and
              rRNA  检测到的独有食物类群显著高于                  COI 基           germplasm  sources  of  wild  Yadong  salmon  population[J].
              因 。 Coker 等  [44]  基 于  18S rRNA  和  COI 对 红 海        Journal of Northeast Agricultural University, 2016, 47(1): 58-
              11  种蝴蝶鱼科     (Chaetodontidae) 鱼类的食物组成                65 (in Chinese).
              分析显示,18S rRNA         获得的    ZOTUS (零半径         [  4  ]   豪富华, 陈毅峰, 唐卫星, 等. 亚东鲑的年龄与生长的研究   [J].
              OTU) 数量明显高于         COI 基因,注释到物种的                     水生生物学报, 2007, 31(5): 731-737.
              数量也高于        COI 基因。尽管       COI与   18S rRNA          Hao F H, Chen Y F, Tang W X, et al. Age and growth of Salmo

              https://www.china-fishery.cn                           中国水产学会主办    sponsored by China Society of Fisheries
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