Page 219 - 《水产学报》2026年第2期
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2 期              覃晓曼，等：基于全基因组测序分析大口黑鲈鰤诺卡氏菌致病性和耐药性                                        50 卷


                                             表 6    分离菌株的药物敏感性实验结果
                                      Tab. 6    Antibiotic susceptibility test of the isolated strain
                      药物分类                 抗生素名称              药物剂量/ μg            抑菌圈直径/mm (敏感度)
                 classification of antibiotics  antibiotic name  dose of antibiotics  inhibition zone diametersensitivity (sensitivity)
                 四环素类抗生素              四环素 tetracycline           30                     38.0 (S)
                 tetracycline antibiotic
                                      多西环素 doxycycline           30                     55.0 (S)
                 β-内酰胺类               氨苄西林 ampicillin            10                      0 (R)
                 β-lactams
                                      青霉素 penicillium            10                      0 (R)
                                      头孢呋辛 zinacef               30                      0 (R)
                 大环内酯类                红霉素 erythromycin           15                      0 (R)
                 macrolides
                 氟喹诺酮类抗生素             氧氟沙星 ofloxacin             5                      40.0 (S)
                 fluoroquinolone antibiotic
                                      环丙沙星 ciprofloxacin         5                       0 (R)
                                      诺氟沙星 norfloxacin           10                      8 (R)
                 磺胺类抗生素               复方新诺 sulfamethoxazole    23.75/1.25                0 (R)
                 sulfonamide antibiotic
                 黏菌素类抗生素              多黏菌素 polymyxin             30                      0 (R)
                 Colistin
                 硝基呋喃类抗生素             呋喃唑酮 urazolidone           30                      0 (R)
                 nitrofuran antibiotics
                 头孢菌素类抗生素             头孢拉定 cefradine             75                      0 (R)
                 cephalosporin
                                      头孢唑啉 cefazolin             30                      0 (R)
                 氨基糖苷类抗生素             庆大霉素 gentamycin            10                     25 (S)
                 aminoglycoside antibiotic
                                      卡那霉素 kanamycin             30                     20 (S)
                                      新霉素 neomycin               30                     40 (S)
                                      丁胺卡那 amikacin              30                     30 (S)
                 氯霉素类抗生素              氯霉素 chloramphenicol        30                     40.5 (S)
                 phenicol antibiotic
              注 S. 敏感；I. 中度敏感；R. 耐药。
              Notes S. sensitive; I. moderately sensitive; R. resistancence.

              兰氏染色、生理生化特征、16S rRNA               和  secA1  基   鰤诺卡氏菌进行进化树分析，发现淡水鱼源和海
              因序列测序分析确定分离菌株为鰤诺卡氏菌。                             水鱼源的鰤诺卡氏菌各自聚为一支，认为来自淡
                   采用  Illumina+PacBio  的测序方式获得了分离             水鱼源和海水鱼源的鰤诺卡氏菌其基因组存在一
              菌株   NS01  的全基因组序列，分离菌株            NS01  的基      定差异。Kim     等  [31]  对分离自日本鳗鲡的鰤诺卡氏
              因组信息与      NCBI 数据库中其他不同地区、不同                    菌  (菌株号：MH196537) 及其他        16  株鰤诺卡氏菌
              宿主分离的鰤诺卡氏菌菌株基因组基础信息基本                            的基因组特征进行了系统比较分析，结果显示，
              一致。将分离菌株         NS01  全基因组序列与       NCBI 中      分离菌株     MH196537  与淡水鱼源鰤诺卡氏菌的
              已知的其他       24  株鰤诺卡氏菌全基因组序列进行                   ANI 值在  0.999 4～0.999 9，而与海水鱼源鰤诺卡
              ANI 分析发现，分离菌株           NS01  与海水鱼源鰤诺            氏菌的   ANI 值则在    0.998 5～0.999 4，该差异揭示
              卡氏菌的遗传距离更近，相似性更高。进一步通                            了淡水鱼源与海水鱼源的鰤诺卡氏菌在基因组水
              过直系同源基因分析研究发现，分离株                    NS01  在     平上存在遗传分化。为了评估分离菌株                    NS01  与
              进化关系上未与其他淡水鱼源鰤诺卡氏菌聚为一                            其他  24  株鰤诺卡氏菌的耐药基因在耐药机制上的
              支，而与海水鱼源鰤诺卡氏菌               UTF1 株等在进化           差异，分别对分离菌株            NS01 与淡水鱼组鰤诺卡
              关系上聚为一支，在遗传进化上有较近的亲缘关                            氏菌和海水鱼组鰤诺卡氏菌的耐药基因进行随机
              系，这与目前所报道的淡水鱼源和海水鱼源鰤诺                            森林分析，研究发现分离菌株               NS01  的耐药基因
              卡氏菌之间得进化关系存在一定差异。张美超等                      [30]  与淡水鱼源鰤诺卡氏菌差异较大，而与海水鱼源
              从  NCBI 数据库中挑选        8  株从患病鱼类上分离的              鰤诺卡氏菌在耐药基因水平上具有较近的亲缘关

              中国水产学会主办  sponsored by China Society of Fisheries                          https://www.china-fishery.cn
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