Page 179 - 《水产学报》2025年第11期
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王孟,等 水产学报, 2025, 49(11): 119315
用伦理委员会批准,实验过程中操作人员严格 采用通用引物 E527F (5'-CYGCGGTAATTCCA
遵守河北大学实验动物管理和使用伦理委员会 GCTC-3') 和 E1009R (5'-AYGGTATCTRATCRT-
[19]
制定的伦理规范,并按照河北大学实验动物管 CTTYG-3') 扩增,扩增长度约 420 bp ,COI
理和使用伦理委员会制定的规章制度执行。 基 因 高 变 区 采 用 通 用 引 物 mlCOIintF (5'-
GGWACWGGWTGAACWGTWTAYCCYCC-3')
1.2 肠道内容物样本的 DNA 提取及测序
和 jgHCO2198 (5'-TAAACTTCAGGGTGACCAA
提取 DNA 之前,离心肠道内容物样本, ARAAYCA-3') 扩增,扩增长度为 313 bp 。扩
[23]
丢弃上层乙醇,放置在 50 ℃ 下直至干燥,干 增总体系均为 25 μL:含有 Barcode 的正反向引
燥后对肠道内容物样本进行匀浆处理,充分匀 物各 1 μL,BSA (2 ng/μL) 3 μL,DNA 模板 2 μL,
浆后的肠道内容物样本每份选取 50 mg,采用 Taq Plus Master Mix 12.5 μL, ddH O 5.5 μL。
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E.Z.N.A.粪 便 DNA 试 剂 盒 (Omega Bio-tek, 美 PCR 扩增条件:94 ℃ 预变性 5 min;94 ℃ 变
国) 参照说明书进行 DNA 提取。使用 Nanodrop 性 30 s,54 ℃ 退火 30 s,72 ℃ 延伸 60 s,35
2000 分光光度计测定 DNA 样品的质量和浓度, 个循环;72 ℃ 延伸 7 min。PCR 产物通过 1%
样品储存在−20 ℃ 直至扩增。18S rRNA V4 区 琼脂糖凝胶电泳进行检测,使用 AMPure XP
表 1 亚东鲑样本的采样点信息、体长、体重和肠道充塞度指标
Tab. 1 Sample sites, body length, weight and gut fullness indicators of S. trutta fario
样本编号 采样点 全长/mm 体长/mm 体重/g 肠道充塞度
sample no. sample site total length body length body weight gut fullness
01 YD2 192.1 171.3 77.6 4
02 YD2 244.1 217.6 166.6 3
03 YD2 219.2 197.4 120.0 5
04 YD2 192.3 170.7 77.5 4
05 YD1 205.6 181.4 80.7 3
06 YD2 233.2 207.6 144.5 2
07 YD2 232.2 206.5 142.5 3
08 YD2 209.8 191.8 104.3 4
09 YD2 235.3 211.9 149.0 3
10 YD2 234.5 206.3 143.6 4
11 YD2 236.2 209.5 166.3 2
12 YD1 196.5 172.8 76.4 3
13 YD2 190.3 170.5 75.2 4
14 YD1 218.6 194.6 117.3 5
15 YD2 246.9 217.8 167.6 2
16 YD2 245.7 230.5 170.9 2
17 YD1 215.7 189.7 116.3 3
18 YD2 241.4 213.8 165.1 3
19 YD1 204.2 179.2 80.8 1
20 YD1 217.8 193.4 117.9 5
21 YD1 210.5 189.5 104.2 4
22 YD2 265.6 237.5 224.7 2
23 YD1 231.2 203.7 142.9 0
24 YD1 204.2 177.8 81.1 0
25 YD1 214.3 191.9 119.9 0
26 YD2 238.4 211.0 160.1 0
中国水产学会主办 sponsored by China Society of Fisheries https://www.china-fishery.cn
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